Bibliografia UJ CM



Zapytanie: STAPOR KATARZYNA
Liczba odnalezionych rekordów: 31



Przejście do opcji zmiany formatu | Wyświetl/ukryj etykiety | Wersja do druku | | | Nowe wyszukiwanie
1/31
Krzysztof Kotowski, Piotr Fabian, Irena Roterman, Katarzyna Stapor.
Convolutional ProteinUnetLM competitive with long short-term memory-based protein secondary structure predictors
Proteins
2023 : Vol. 91, nr 5, s. 608-618, il., bibliogr. 58 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Katarzyna Stapor
Online First 2022-11-30
p-ISSN: 0887-3585
e-ISSN: 1097-0134
AZ
ORG
AIF
IF: 2.900
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
2/31
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Leszek Konieczny.
New insights on the catalytic center of proteins from peptidylprolyl isomerase group based on the FOD-M model
Journal of Cellular Biochemistry
2023 : Vol. 124, nr 6, s. 818-835, il., bibliogr., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC 4.0
Online First 2023-05-04
p-ISSN: 0730-2312
e-ISSN: 1097-4644
AZ
ORG
AIF
IF: 4.000
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
3/31
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Leszek Konieczny.
Secondary structure in amyloids in relation to their wild type forms.
International Journal of Molecular Sciences
2023 : Vol. 24, nr 1, il., bibliogr. 41 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0
e-ISSN: 1422-0067
AZ
ORG
AIF
IF: 5.600
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
4/31
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Dawid Dułak, Leszek Konieczny.
Secondary structure in polymorphic forms of alpha-synuclein amyloids
Acta Biochimica Polonica
2023 : Vol. 70, nr 2, s. 435-445, il., bibliogr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-SA 4.0
p-ISSN: 0001-527X
e-ISSN: 1734-154X
AP
ORG
AIF
IF: 1.700
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
5/31
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Leszek Konieczny.
Structural specificity of polymorphic forms of α-synuclein amyloid
Biomedicines
2023 : Vol. 11, nr 5, il., bibliogr. 82 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0
e-ISSN: 2227-9059
AZ
ORG
AIF
IF: 4.700
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
6/31
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Piotr Fabian, Leszek Konieczny.
Connexins and pannexins - similarities and differences according to the FOD-M model.
Biomedicines
2022 : Vol. 10, nr 7, il., bibliogr. 70 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
e-ISSN: 2227-9059
AZ
ORG
AIF
IF: 4.700
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
7/31
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Krzysztof Gądek, Tomasz Gubała, Piotr Nowakowski, Piotr Fabian, Leszek Konieczny.
Dependence of protein structure on environment : FOD model applied to membrane proteins.
Membranes
2022 : Vol. 12, nr 1, il., bibliogr. 38 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
p-ISSN: 2077-0375
AZ
ORG
AIF
IF: 4.200
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
8/31
Katarzyna Stapor, Krzysztof Kotowski, Tomasz Smolarczyk, Irena Roterman.
Lightweight ProteinUnet2 network for protein secondary structure prediction : a step towards proper evaluation.
BMC Bioinformatics
2022 : Vol. 23, nr 1, il., bibliogr. 51 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Katarzyna Stapor.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
e-ISSN: 1471-2105
AZ
ORG
AIF
IF: 3.000
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
9/31
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Piotr Fabian, Leszek Konieczny.
New insights into disordered proteins and regions according to the FOD-M model
PLoS One
2022 : Vol. 17, nr 10, il., bibliogr. 58 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0
e-ISSN: 1932-6203
AZ
ORG
AIF
IF: 3.700
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
10/31
Irena Roterman, Adam Sieradzan, Katarzyna Stapor, Patryk Wesołowski, Leszek Konieczny.
On the need to introduce environmental characteristics in ab initio protein structure prediction using a coarse-grained UNRES force field.
Journal of Molecular Graphics & Modelling
2022 : Vol. 114, il., bibliogr. 60 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.
p-ISSN: 1093-3263
e-ISSN: 1873-4243
AZ
ORG
AIF
IF: 2.900
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
11/31
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Leszek Konieczny.
The Contribution of hydrophobic interactions to conformational changes of Inward/Outward transmembrane transport proteins
Membranes
2022 : Vol. 12, nr 12, il., bibliogr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0
p-ISSN: 2077-0375
AZ
ORG
AIF
IF: 4.200
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
12/31
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Dawid Dułak, Leszek Konieczny.
The possible mechanism of amyloid transformation based on the geometrical parameters of early-stage intermediate in silico model for protein folding.
International Journal of Molecular Sciences
2022 : Vol. 23, nr 16, il., bibliogr. 101 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
e-ISSN: 1422-0067
AZ
ORG
AIF
IF: 5.600
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
13/31
Mateusz Banach, Katarzyna Stapor, Piotr Fabian, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Divergence Entropy-Based Evaluation of Hydrophobic Core in Aggressive and Resistant Forms of Transthyretin.
Entropy
2021 : Vol. 23, nr 4, il., bibliogr. 64 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
p-ISSN: 1099-4300
AZ
ORG
AIF
IF: 2.738
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
14/31
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Piotr Fabian, Leszek Konieczny.
In silico modeling of the influence of environment on amyloid folding using FOD-M model.
International Journal of Molecular Sciences
2021 : Vol. 22, nr 19, il., bibliogr. 139 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
p-ISSN: 1661-6596
e-ISSN: 1422-0067
AZ
ORG
AIF
IF: 6.208
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
15/31
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Piotr Fabian, Leszek Konieczny, Mateusz Banach.
Model of Environmental Membrane Field for Transmembrane Proteins.
International Journal of Molecular Sciences
2021 : Vol. 22, nr 7, il., bibliogr. 43 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
p-ISSN: 1661-6596
e-ISSN: 1422-0067
AZ
ORG
AIF
IF: 6.208
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
16/31
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Krzysztof Gądek, Tomasz Gubała, Piotr Nowakowski, Piotr Fabian, Leszek Konieczny.
On the dependence of prion and amyloid structure on the folding environment
International Journal of Molecular Sciences
2021 : Vol. 22, nr 24, il., bibliogr. 75 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0
e-ISSN: 1422-0067
AZ
ORG
AIF
IF: 6.208
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
17/31
Krzysztof Kotowski, Tomasz Smolarczyk, Irena Roterman-Konieczna, Katarzyna Stapor.
ProteinUnet-An efficient alternative to SPIDER3-single for sequence-based prediction of protein secondary structures.
Journal of Computational Chemistry
2021 : Vol. 42, nr 1, s. 50-59, il., bibliogr. 40 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Katarzyna Stapor.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC 4.0.
p-ISSN: 0192-8651
e-ISSN: 1096-987X
AZ
ORG
AIF
IF: 3.672
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
18/31
Magdalena Ptak-Kaczor, Mateusz Banach, Katarzyna Stapor, Piotr Fabian, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Solubility and Aggregation of Selected Proteins Interpreted on the Basis of Hydrophobicity Distribution.
International Journal of Molecular Sciences
2021 : Vol. 22, nr 9, il., bibliogr. 49 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
e-ISSN: 1422-0067
AZ
ORG
AIF
IF: 6.208
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
19/31
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Piotr Fabian, Leszek Konieczny.
The functional significance of hydrophobic residue distribution in bacterial beta-barrel transmembrane proteins.
Membranes
2021 : Vol. 11, nr 8, il., bibliogr. 53 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
e-ISSN: 2077-0375
AZ
ORG
AIF
IF: 4.562
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
20/31
Piotr Fabian, Katarzyna Stapor, Mateusz Banach, Magdalena Ptak-Kaczor, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Alternative Hydrophobic Core in Proteins - The Effect of Specific Synergy.
Symmetry
2020 : Vol. 12, nr 2, il., bibliogr. 67 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
e-ISSN: 2073-8994
AZ
ORG
AIF
IF: 2.713
Adres url:
21/31
Mateusz Banach, Katarzyna Stapor, Leszek Konieczny, Piotr Fabian, Irena Roterman.
Downhill, Ultrafast and Fast Folding Proteins Revised.
International Journal of Molecular Sciences
2020 : Vol. 21, nr 20, il., bibliogr. 69 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
p-ISSN: 1422-0067
AZ
ORG
AIF
IF: 5.924
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
22/31
Dawid Dułak, Małgorzata Gadzała, Katarzyna Stapor, Piotr Fabian, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Folding with active participation of water.
W: From Globular Proteins to Amyloids.
Edited by Irena Roterman-Konieczna.
Amsterdam ; Oxford ; Cambridge : Elsevier, 2020.
s. 13-26 : il., bibliogr. 10 poz.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.
Chapter 2.
p-ISBN: 978-0-08-102981-7
RMZ
ORG
RMZ
Adres url:
DOI:
23/31
Mateusz Banach, Piotr Fabian, Katarzyna Stapor, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Identification of tunnels as in potato hydrolases.
Bioinformation
2020 : Vol. 16, nr 1, s. 21-25, il., bibliogr. 17 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY.
p-ISSN: 0973-2063
AZ
ORG
APZ
IF: 0.310
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
24/31
Tomasz Smolarczyk, Irena Roterman-Konieczna, Katarzyna Stapor.
Protein Secondary Structure Prediction : A Review of Progress and Directions.
Current Bioinformatics
2020 : Vol. 15, nr 2, s. 90-107, il., bibliogr. 129 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Katarzyna Stapor.
p-ISSN: 1574-8936
e-ISSN: 2212-392X
AZ
POG
AIF
IF: 3.543
Adres url:
25/31
Mateusz Banach, Piotr Fabian, Katarzyna Stapor, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Structure of the Hydrophobic Core Determines the 3D Protein Structure-Verification by Single Mutation Proteins.
Biomolecules
2020 : Vol. 10, nr 5, il., bibliogr. 59 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
p-ISSN: 2218-273X
AZ
ORG
AIF
IF: 4.879
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
26/31
Mateusz Banach, Piotr Fabian, Katarzyna Stapor, Leszek Konieczny, Magdalena Ptak-Kaczor, Irena Roterman.
The Status of Edge Strands in Ferredoxin-Like Fold.
Symmetry
2020 : Vol. 12, nr 6, il., bibliogr. 35 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
ISSN: 2073-8994
AZ
ORG
AIF
IF: 2.713
Adres url:
DOI:
27/31
Piotr Fabian, Mateusz Banach, Katarzyna Stapor, Leszek Konieczny, Magdalena Ptak-Kaczor, Irena Roterman.
The Structure of Amyloid Versus the Structure of Globular Proteins.
International Journal of Molecular Sciences
2020 : Vol. 21, nr 13, il., bibliogr. 39 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
p-ISSN: 1422-0067
AZ
ORG
AIF
IF: 5.924
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
28/31
Tomasz Smolarczyk, Katarzyna Stapor, Irena Roterman-Konieczna.
Backbone dihedral angles prediction servers for protein early-stage structure prediction.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2019 : Vol. 15, nr 4, 20190034, il., bibliogr. 35 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Tomasz Smolarczyk.
p-ISSN: 1895-9091
AP
ORG
KBN
Adres url:
29/31
Piotr Fabian, Katarzyna Stapor, Mateusz Banach, Magdalena Ptak-Kaczor, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Different Synergy in Amyloids and Biologically Active Forms of Proteins.
International Journal of Molecular Sciences
2019 : Vol. 20, nr 18, 4436, il., bibliogr. 45 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
p-ISSN: 1422-0067
AZ
ORG
AIF
IF: 4.556
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
30/31
Katarzyna Stapor, Irena Roterman-Konieczna, Piotr Fabian.
Machine Learning Methods for the Protein Fold Recognition Problem.
W: Machine Learning Paradigms : Advances in Data Analytics.
Editors: George A. Tsihrintzis, Dionisios N. Sotiropoulos, Lakhmi C. Jain.
Cham : Springer International Publishing AG, part of Springer Nature, 2019.
s. 101-127 : il., bibliogr. 77 poz.
p-ISSN: 1868-4394
e-ISSN: 1868-4408
p-ISBN: 978-3-319-94029-8
p-ISBN: 978-3-319-94030-4
RMZ
ORG
RMZ
Adres url:
DOI:
31/31
Piotr Fabian, Katarzyna Stapor, Irena Roterman.
Model of Early Stage Intermediate in Respect to Its Final Structure.
Biomolecules
2019 : Vol. 9, nr 12, 866, il., bibliogr. 39 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
p-ISSN: 2218-273X
AZ
ORG
AIF
IF: 4.082
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
  Wyświetl ponownie stosując format:
Wyświetl/ukryj etykiety | Wyświetlenie wyników w wersji do druku | Pobranie pliku do edytora | Nowe wyszukiwanie | Biblioteka Medyczna UJ