Bibliografia UJ CM




Zapytanie: KONIECZNY LESZEK
Liczba odnalezionych rekordów: 227



Przejście do opcji zmiany formatu | Wyświetl/ukryj etykiety | Wersja do druku | | | Nowe wyszukiwanie
1/227
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Leszek Konieczny.
New insights on the catalytic center of proteins from peptidylprolyl isomerase group based on the FOD-M model
Journal of Cellular Biochemistry
2023 : Vol. 124, nr 6, s. 818-835, il., bibliogr., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC 4.0
Online First 2023-05-04

p-ISSN: 0730-2312
e-ISSN: 1097-4644

AZ
ORG
AIF
IF: 4.000
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
2/227
Irena Roterman, Leszek Konieczny.
Protein is an intelligent micelle
Entropy
2023 : Vol. 25, nr 6, il., bibliogr. 52 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.

p-ISSN: 1099-4300

AZ
ORG
AIF
IF: 2.700
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
3/227
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Leszek Konieczny.
Secondary structure in amyloids in relation to their wild type forms.
International Journal of Molecular Sciences
2023 : Vol. 24, nr 1, il., bibliogr. 41 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0

e-ISSN: 1422-0067

AZ
ORG
AIF
IF: 5.600
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
4/227
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Dawid Dułak, Leszek Konieczny.
Secondary structure in polymorphic forms of alpha-synuclein amyloids
Acta Biochimica Polonica
2023 : Vol. 70, nr 2, s. 435-445, il., bibliogr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-SA 4.0

p-ISSN: 0001-527X
e-ISSN: 1734-154X

AP
ORG
AIF
IF: 1.700
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
5/227
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Leszek Konieczny.
Structural specificity of polymorphic forms of α-synuclein amyloid
Biomedicines
2023 : Vol. 11, nr 5, il., bibliogr. 82 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0

e-ISSN: 2227-9059

AZ
ORG
AIF
IF: 4.700
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
6/227
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Piotr Fabian, Leszek Konieczny.
Connexins and pannexins - similarities and differences according to the FOD-M model.
Biomedicines
2022 : Vol. 10, nr 7, il., bibliogr. 70 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.

e-ISSN: 2227-9059

AZ
ORG
AIF
IF: 4.700
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
7/227
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Krzysztof Gądek, Tomasz Gubała, Piotr Nowakowski, Piotr Fabian, Leszek Konieczny.
Dependence of protein structure on environment : FOD model applied to membrane proteins.
Membranes
2022 : Vol. 12, nr 1, il., bibliogr. 38 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.

p-ISSN: 2077-0375

AZ
ORG
AIF
IF: 4.200
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
8/227
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Piotr Fabian, Leszek Konieczny.
New insights into disordered proteins and regions according to the FOD-M model
PLoS One
2022 : Vol. 17, nr 10, il., bibliogr. 58 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0

e-ISSN: 1932-6203

AZ
ORG
AIF
IF: 3.700
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
9/227
Irena Roterman, Adam Sieradzan, Katarzyna Stapor, Patryk Wesołowski, Leszek Konieczny.
On the need to introduce environmental characteristics in ab initio protein structure prediction using a coarse-grained UNRES force field.
Journal of Molecular Graphics & Modelling
2022 : Vol. 114, il., bibliogr. 60 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.

p-ISSN: 1093-3263
e-ISSN: 1873-4243

AZ
ORG
AIF
IF: 2.900
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
10/227
M[ałgorzata] Lasota, J[anina] Rybarska, L[eszek] Konieczny, G[rzegorz] Zemanek, J[acek] Zagajewski, K[atarzyna] Chlopas, D. Jankowski, I[zabela] Koscik, A. Skulska-Birgiel, A. Wisniewska, M[ałgorzata] Iciek, E[wa] Jasek-Gajda, M[ałgorzata] Jasinska, A[nna] Jagusiak.
Property of a new prussian blue-bounded iron complex able to peroxidate non-saturated fatty acids with a tendency to create conditions that may encourage ferroptosis
Journal of Physiology and Pharmacology
2022 : Vol. 73, nr 5, s. 673-686, il., bibliogr.
Autor korespondencyjny: Anna Jagusiak, Malgorzata Lasota
p-ISSN: 0867-5910
e-ISSN: 1899-1505

AP
ORG
AIF
IF: 2.200
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
11/227
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Leszek Konieczny.
The Contribution of hydrophobic interactions to conformational changes of Inward/Outward transmembrane transport proteins
Membranes
2022 : Vol. 12, nr 12, il., bibliogr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0

p-ISSN: 2077-0375

AZ
ORG
AIF
IF: 4.200
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
12/227
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Dawid Dułak, Leszek Konieczny.
The possible mechanism of amyloid transformation based on the geometrical parameters of early-stage intermediate in silico model for protein folding.
International Journal of Molecular Sciences
2022 : Vol. 23, nr 16, il., bibliogr. 101 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.

e-ISSN: 1422-0067

AZ
ORG
AIF
IF: 5.600
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
13/227
Mateusz Banach, Katarzyna Stapor, Piotr Fabian, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Divergence Entropy-Based Evaluation of Hydrophobic Core in Aggressive and Resistant Forms of Transthyretin.
Entropy
2021 : Vol. 23, nr 4, il., bibliogr. 64 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.

p-ISSN: 1099-4300

AZ
ORG
AIF
IF: 2.738
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
14/227
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Piotr Fabian, Leszek Konieczny.
In silico modeling of the influence of environment on amyloid folding using FOD-M model.
International Journal of Molecular Sciences
2021 : Vol. 22, nr 19, il., bibliogr. 139 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.

p-ISSN: 1661-6596
e-ISSN: 1422-0067

AZ
ORG
AIF
IF: 6.208
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
15/227
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Piotr Fabian, Leszek Konieczny, Mateusz Banach.
Model of Environmental Membrane Field for Transmembrane Proteins.
International Journal of Molecular Sciences
2021 : Vol. 22, nr 7, il., bibliogr. 43 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.

p-ISSN: 1661-6596
e-ISSN: 1422-0067

AZ
ORG
AIF
IF: 6.208
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
16/227
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Krzysztof Gądek, Tomasz Gubała, Piotr Nowakowski, Piotr Fabian, Leszek Konieczny.
On the dependence of prion and amyloid structure on the folding environment
International Journal of Molecular Sciences
2021 : Vol. 22, nr 24, il., bibliogr. 75 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0

e-ISSN: 1422-0067

AZ
ORG
AIF
IF: 6.208
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
17/227
Magdalena Ptak-Kaczor, Mateusz Banach, Katarzyna Stapor, Piotr Fabian, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Solubility and Aggregation of Selected Proteins Interpreted on the Basis of Hydrophobicity Distribution.
International Journal of Molecular Sciences
2021 : Vol. 22, nr 9, il., bibliogr. 49 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.

e-ISSN: 1422-0067

AZ
ORG
AIF
IF: 6.208
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
18/227
Irena Roterman, Katarzyna Stapor, Piotr Fabian, Leszek Konieczny.
The functional significance of hydrophobic residue distribution in bacterial beta-barrel transmembrane proteins.
Membranes
2021 : Vol. 11, nr 8, il., bibliogr. 53 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.

e-ISSN: 2077-0375

AZ
ORG
AIF
IF: 4.562
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
19/227
Piotr Fabian, Katarzyna Stapor, Mateusz Banach, Magdalena Ptak-Kaczor, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Alternative Hydrophobic Core in Proteins - The Effect of Specific Synergy.
Symmetry
2020 : Vol. 12, nr 2, il., bibliogr. 67 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.

e-ISSN: 2073-8994

AZ
ORG
AIF
IF: 2.713
Adres url:
20/227
Dawid Dułak, Małgorzata Gadzała, Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Alternative Structures of α-Synuclein.
Molecules
2020 : Vol. 25, nr 3, il., bibliogr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.

p-ISSN: 1420-3049

AZ
ORG
AIF
IF: 4.412
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
21/227
Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Anti-amyloid drug design.
W: From Globular Proteins to Amyloids.
Edited by Irena Roterman-Konieczna.
Amsterdam ; Oxford ; Cambridge : Elsevier, 2020.
s. 215-231 : il., bibliogr. 40 poz.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.
Chapter 11.

p-ISBN: 978-0-08-102981-7

RMZ
ORG
RMZ
Adres url:
DOI:
22/227
Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Composite structures.
W: From Globular Proteins to Amyloids.
Edited by Irena Roterman-Konieczna.
Amsterdam ; Oxford ; Cambridge : Elsevier, 2020.
s. 117-133 : il., bibliogr. 6 poz.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.
Chapter 8.

p-ISBN: 978-0-08-102981-7

RMZ
ORG
RMZ
Adres url:
DOI:
23/227
Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Description of the fuzzy oil drop model.
W: From Globular Proteins to Amyloids.
Edited by Irena Roterman-Konieczna.
Amsterdam ; Oxford ; Cambridge : Elsevier, 2020.
s. 1-11 : il., bibliogr. 16 poz.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.
Chapter 1.

p-ISBN: 978-0-08-102981-7

RMZ
ORG
RMZ
Adres url:
DOI:
24/227
Mateusz Banach, Katarzyna Stapor, Leszek Konieczny, Piotr Fabian, Irena Roterman.
Downhill, Ultrafast and Fast Folding Proteins Revised.
International Journal of Molecular Sciences
2020 : Vol. 21, nr 20, il., bibliogr. 69 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.

p-ISSN: 1422-0067

AZ
ORG
AIF
IF: 5.924
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
25/227
Dawid Dułak, Małgorzata Gadzała, Katarzyna Stapor, Piotr Fabian, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Folding with active participation of water.
W: From Globular Proteins to Amyloids.
Edited by Irena Roterman-Konieczna.
Amsterdam ; Oxford ; Cambridge : Elsevier, 2020.
s. 13-26 : il., bibliogr. 10 poz.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.
Chapter 2.

p-ISBN: 978-0-08-102981-7

RMZ
ORG
RMZ
Adres url:
DOI:
26/227
Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Globular or ribbon-like micelle.
W: From Globular Proteins to Amyloids.
Edited by Irena Roterman-Konieczna.
Amsterdam ; Oxford ; Cambridge : Elsevier, 2020.
s. 41-54 : il., bibliogr. 43 poz.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.
Chapter 4.

p-ISBN: 978-0-08-102981-7

RMZ
ORG
RMZ
Adres url:
DOI:
27/227
Mateusz Banach, Piotr Fabian, Katarzyna Stapor, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Identification of tunnels as in potato hydrolases.
Bioinformation
2020 : Vol. 16, nr 1, s. 21-25, il., bibliogr. 17 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY.

p-ISSN: 0973-2063

AZ
ORG
APZ
IF: 0.310
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
28/227
Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Information encoded in protein structure.
W: From Globular Proteins to Amyloids.
Edited by Irena Roterman-Konieczna.
Amsterdam ; Oxford ; Cambridge : Elsevier, 2020.
s. 27-39 : il., bibliogr. 19 poz.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.
Chapter 3.

p-ISBN: 978-0-08-102981-7

RMZ
ORG
RMZ
Adres url:
DOI:
29/227
Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Ligand binding cavity encoded as a local hydrophobicity deficiency.
W: From Globular Proteins to Amyloids.
Edited by Irena Roterman-Konieczna.
Amsterdam ; Oxford ; Cambridge : Elsevier, 2020.
s. 91-93 : il., bibliogr. 4 poz.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.
Chapter 6C.

p-ISBN: 978-0-08-102981-7

RMZ
ORG
RMZ
Adres url:
DOI:
30/227
Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Local discordance.
W: From Globular Proteins to Amyloids.
Edited by Irena Roterman-Konieczna.
Amsterdam ; Oxford ; Cambridge : Elsevier, 2020.
s. 69 : il.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.
Chapter 6.

p-ISBN: 978-0-08-102981-7

RMZ
ORG
RMZ
Adres url:
DOI:
31/227
Irena Roterman, Leszek Konieczny.
Protein folding vs. COVID-19 and the Mediterranean diet.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2020 : Vol. 16, nr 2, il., bibliogr., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
p-ISSN: 1895-9091

AP
ORG
KBN
Adres url:
32/227
Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Protein-protein interaction encoded as an exposure of hydrophobic residues on the surface.
W: From Globular Proteins to Amyloids.
Edited by Irena Roterman-Konieczna.
Amsterdam ; Oxford ; Cambridge : Elsevier, 2020.
s. 79-89 : il., bibliogr. 7 poz.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.
Chapter 6B.

p-ISBN: 978-0-08-102981-7

RMZ
ORG
RMZ
Adres url:
DOI:
33/227
Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Proteins structured as spherical micelles.
W: From Globular Proteins to Amyloids.
Edited by Irena Roterman-Konieczna.
Amsterdam ; Oxford ; Cambridge : Elsevier, 2020.
s. 55-68 : il., bibliogr. 10 poz.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.
Chapter 5.

p-ISBN: 978-0-08-102981-7

RMZ
ORG
RMZ
Adres url:
DOI:
34/227
Mateusz Banach, Piotr Fabian, Katarzyna Stapor, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Structure of the Hydrophobic Core Determines the 3D Protein Structure-Verification by Single Mutation Proteins.
Biomolecules
2020 : Vol. 10, nr 5, il., bibliogr. 59 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.

p-ISSN: 2218-273X

AZ
ORG
AIF
IF: 4.879
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
35/227
Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Summary : Protein is an intelligent micelle.
W: From Globular Proteins to Amyloids.
Edited by Irena Roterman-Konieczna.
Amsterdam ; Oxford ; Cambridge : Elsevier, 2020.
s. 241-252 : il., bibliogr. 64 poz.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.
p-ISBN: 978-0-08-102981-7

RMZ
ORG
RMZ
Adres url:
DOI:
36/227
Krzysztof Mikuta, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
System to simulate the activity of living organism - construction of proteome.
Journal of Computational Science
2020 : Vol. 45, il., bibliogr. 24 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
p-ISSN: 1877-7503

AZ
ORG
AIF
IF: 3.976
Adres url:
37/227
Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
The active site in a single-chain enzyme.
W: From Globular Proteins to Amyloids.
Edited by Irena Roterman-Konieczna.
Amsterdam ; Oxford ; Cambridge : Elsevier, 2020.
s. 71-78 : il., bibliogr. 4 poz.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.
Chapter 6A.

p-ISBN: 978-0-08-102981-7

RMZ
ORG
RMZ
Adres url:
DOI:
38/227
Leszek Konieczny, Irena Roterman.
The COVID-19 Puzzle.
Bioinformation
2020 : Vol. 16, nr 5, s. 418-421, bibliogr. 22 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY.

p-ISSN: 0973-2063

EDI
IF: 0.310
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
39/227
Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
The hypothetical amyloid transformation of transthyretin.
W: From Globular Proteins to Amyloids.
Edited by Irena Roterman-Konieczna.
Amsterdam ; Oxford ; Cambridge : Elsevier, 2020.
s. 233-240 : il., bibliogr. 22 poz.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.
Chapter 12.

p-ISBN: 978-0-08-102981-7

RMZ
ORG
RMZ
Adres url:
DOI:
40/227
Mateusz Banach, Piotr Fabian, Katarzyna Stapor, Leszek Konieczny, Magdalena Ptak-Kaczor, Irena Roterman.
The Status of Edge Strands in Ferredoxin-Like Fold.
Symmetry
2020 : Vol. 12, nr 6, il., bibliogr. 35 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.

ISSN: 2073-8994

AZ
ORG
AIF
IF: 2.713
Adres url:
DOI:
41/227
Piotr Fabian, Mateusz Banach, Katarzyna Stapor, Leszek Konieczny, Magdalena Ptak-Kaczor, Irena Roterman.
The Structure of Amyloid Versus the Structure of Globular Proteins.
International Journal of Molecular Sciences
2020 : Vol. 21, nr 13, il., bibliogr. 39 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.

p-ISSN: 1422-0067

AZ
ORG
AIF
IF: 5.924
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
42/227
Anna Jagusiak, Joanna Rybarska, Leszek Konieczny, Barbara Piekarska, Barbara Stopa, Katarzyna Chłopaś, Grzegorz Zemanek, Irena Roterman.
Amyloids, Congo red and the apple-green effect.
Acta Biochimica Polonica
2019 : Vol. 66, nr 1, s. 39-46, il., bibliogr.
Autor korespondencyjny: Anna Jagusiak.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-SA 4.0.

p-ISSN: 0001-527X

AP
ORG
AIF
IF: 1.420
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
43/227
Piotr Fabian, Katarzyna Stapor, Mateusz Banach, Magdalena Ptak-Kaczor, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Different Synergy in Amyloids and Biologically Active Forms of Proteins.
International Journal of Molecular Sciences
2019 : Vol. 20, nr 18, 4436, il., bibliogr. 45 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.

p-ISSN: 1422-0067

AZ
ORG
AIF
IF: 4.556
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
44/227
M[ateusz] Banach, L[eszek] Konieczny, I[rena] Roterman.
Fuzzy Oil Drop Model Application-From Globular Proteins to Amyloids.
W: Computational Methods to Study the Structure and Dynamics of Biomolecules and Biomolecular Processes. From Bioinformatics to Molecular Quantum Mechanics.
Editor Adam Liwo.
Second edition.
New York, NY : Springer Berlin Heidelberg, 2019
s. 639-658
(Springer Series in Bio-Neuroinformatics ; vol. 8)
Nowy rozdział.

p-ISSN: 2520-8535
e-ISSN: 2520-8543

p-ISBN: 978-3-319-95842-2
e-ISBN: 978-3-319-95843-9

RMZ
ORG
RMZ
Adres url:
DOI:
45/227
Magdalena Ptak-Kaczor, Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Internal force field in selected proteins.
Acta Biochimica Polonica
2019 : Vol. 66, nr 4, Part I, s. 451-458, il., bibliogr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-SA 4.0.

p-ISSN: 0001-527X

AP
ORG
AIF
IF: 1.420
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
46/227
Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Personalized precision medicine.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2019 : Vol. 15, nr 4, 20190047, il., bibliogr. 50 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Leszek Konieczny.
p-ISSN: 1895-9091

AP
POG
KBN
Adres url:
47/227
Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Secondary and Supersecondary Structure of Proteins in Light of the Structure of Hydrophobic Cores.
W: Protein supersecondary structures. Methods and Protocols.
Edited by Alexander E. Kister.
Second edition.
New York, NY : Springer Science + Business Media, 2019
s. 347-378 : bibliogr. 68 poz., abstr.
Nowy rozdział.
Methods in Molecular Biology ; Vol. 1958
p-ISSN: 1064-3745
e-ISSN: 1940-6029

p-ISBN: 978-1-4939-9160-0
e-ISBN: 978-1-4939-9161-7

RMZ
ORG
RMZ
Adres url:
DOI:
48/227
Irena Roterman, Dawid Dułak, Małgorzata Gadzała, Mateusz Banach, Leszek Konieczny.
Structural analysis of the Aβ(11-42) amyloid fibril based on hydrophobicity distribution.
Journal of Computer-Aided Molecular Design
2019 : Vol. 33, nr 7, s. 665-675, il., bibliogr. 36 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.

p-ISSN: 0920-654X
e-ISSN: 1573-4951

AZ
ORG
AIF
IF: 2.546
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
49/227
Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Symmetry and Dissymmetry in Protein Structure-System-Coding Its Biological Specificity.
Symmetry
2019 : Vol. 11, nr 10, 1215, il., bibliogr. 41 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.

e-ISSN: 2073-8994

AZ
ORG
AIF
IF: 2.645
Adres url:
50/227
Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
The Amyloid as a Ribbon-Like Micelle in Contrast to Spherical Micelles Represented by Globular Proteins.
Molecules
2019 : Vol. 24, nr 23, 4395, il., bibliogr. 80 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.

p-ISSN: 1420-3049

AZ
ORG
AIF
IF: 3.267
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
51/227
Małgorzata Gadzała, Dawid Dułak, Barbara Kalinowska, Zbigniew Baster, Michał Bryliński, Leszek Konieczny, Mateusz Banach, Irena Roterman.
The aqueous environment as an active participant in the protein folding process.
Journal of Molecular Graphics & Modelling
2019 : Vol. 87, s. 227-239, il., bibliogr. 73 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Dawid Dułak, Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.

p-ISSN: 1093-3263

AZ
ORG
AIF
IF: 2.079
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
52/227
Irena Roterman, Leszek Konieczny.
The living organism : evolutionary design or an accident
Bio-Algorithms and Med-Systems
2019 : Vol. 15, nr 3 art. no. 20190035, s. 1-6, il., bibliogr. 46 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Leszek Konieczny.
p-ISSN: 1895-9091

AP
ORG
KBN
Adres url:
53/227
Grażyna Drabik, Jolanta Kaszuba-Zwoińska, Zdzisław Wiśniowski, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Chromatin 3D - will it make understanding of cancer transformation finally possible?
Bio-Algorithms and Med-Systems
2018 : Vol. 14, nr 1 art. no. 20180002, s. 1-6, il., bibliogr. 41 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
p-ISSN: 1895-9091

AP
ORG
KBN
Adres url:
54/227
Dawid Dułak, Mateusz Banach, Zdzisław Wiśniowski, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Comparison of the structure of Aβ(1-40) amyloid with the one in complex with polyphenol ε-viniferin glucoside (EVG).
Bio-Algorithms and Med-Systems
2018 : Vol. 14, nr 2 art. no. 20180008, s. 1-5, il., bibliogr. 21 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
p-ISSN: 1895-9091

AP
ORG
KBN
Adres url:
55/227
Dawid Dułak, Małgorzata Gadzała, Mateusz Banach, Magdalena Ptak, Zdzisław Wiśniowski, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Filamentous Aggregates of Tau Proteins Fulfil Standard Amyloid Criteria Provided by the Fuzzy Oil Drop (FOD) Model.
International Journal of Molecular Sciences
2018 : Vol. 19, nr 10 art. no. 2910, s. 1-29, il., bibliogr. 82 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.

p-ISSN: 1422-0067

AZ
ORG
AIF
IF: 4.183
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
56/227
Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Zdzisław Wiśniowski, Irena Roterman.
Fragment Aβ(18-41) presented within the CDR3 loop region of a shark immunoglobulin new antigen receptor single-variable domain antibody analyzed based on the fuzzy oil drop model.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2018 : Vol. 14, nr 3 art. no. 20180028, s. 1-5, il., bibliogr. 11 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
p-ISSN: 1895-9091

AP
ORG
KBN
Adres url:
57/227
Olga Woźnicka, Joanna Rybarska, Anna Jagusiak, Leszek Konieczny, Barbara Stopa, Irena Roterman.
Metal ions introduced to proteins by supramolecular ligands.
W: Self-Assembled Molecules - New Kind of Protein Ligands : Supramolecular Ligands.
Editors: Irena Roterman, Leszek Konieczny.
New York, NY : Springer Berlin Heidelberg, 2018.
s. 61-76.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
Autor korespondencyjny: Olga Woźnicka.
Library of Congress Control Numer: 2017953533.

p-ISBN: 978-3-319-65638-0
e-ISBN: 978-3-319-65639-7

RMZ
ORG
RMZ
Adres url: *
DOI:
58/227
Mateusz Banach, Barbara Kalinowska, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Possible mechanism of amyloidogenesis of V domains.
W: Self-Assembled Molecules - New Kind of Protein Ligands : Supramolecular Ligands.
Editors: Irena Roterman, Leszek Konieczny.
New York, NY : Springer Berlin Heidelberg, 2018.
s. 77-100 : il. bibliogr. 31 poz.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
Autor korespondencyjny: Mateusz Banach.
Library of Congress Control Numer: 2017953533.

p-ISBN: 978-3-319-65638-0
e-ISBN: 978-3-319-65639-7

RMZ
ORG
RMZ
Adres url: *
DOI:
59/227
Self-Assembled Molecules - New Kind of Protein Ligands : Supramolecular Ligands.
Editors: Irena Roterman, Leszek Konieczny.
New York, NY : Springer Berlin Heidelberg, 2018.
XII, 136 s. : il.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
Library of Congress Control Numer: 2017953533.
Data udostępnienia w sposób otwarty: 2017-11-04

p-ISBN: 978-3-319-65638-0
e-ISBN: 978-3-319-65639-7

MRZ
RED
MRZ
Adres url:
DOI:
60/227
Dawid Dułak, Mateusz Banach, Małgorzata Gadzała, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Structural analysis of the Aβ(15-40) amyloid fibril based on hydrophobicity distribution.
Acta Biochimica Polonica
2018 : Vol. 65, nr 4, s. 595-604, il., bibliogr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-SA 4.0.

p-ISSN: 0001-527X

AP
ORG
AIF
IF: 1.626
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
61/227
Anna Jagusiak, Joanna Rybarska, Barbara Piekarska, Barbara Stopa, Leszek Konieczny.
Supramolecular Congo red as specific ligand of antibodies engaged in immune complex.
W: Self-Assembled Molecules - New Kind of Protein Ligands : Supramolecular Ligands.
Editors: Irena Roterman, Leszek Konieczny.
New York, NY : Springer Berlin Heidelberg, 2018.
s. 21-42 : il., bibliogr. 43 poz.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
Library of Congress Control Numer: 2017953533.
Autor korespondencyjny: Anna Jagusiak.

p-ISBN: 978-3-319-65638-0
e-ISBN: 978-3-319-65639-7

RMZ
ORG
RMZ
Adres url: *
DOI:
62/227
Joanna Rybarska, Barbara Piekarska, Barbara Stopa, Grzegorz Zemanek, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Supramolecular systems as protein ligands.
W: Self-Assembled Molecules - New Kind of Protein Ligands : Supramolecular Ligands.
Editors: Irena Roterman, Leszek Konieczny.
New York, NY : Springer Berlin Heidelberg, 2018.
s. 1-20 : il., bibliogr. 48 poz.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
Autor korespondencyjny: Joanna Rybarska.
Library of Congress Control Numer: 2017953533.

p-ISBN: 978-3-319-65638-0
e-ISBN: 978-3-319-65639-7

RMZ
ORG
RMZ
Adres url: *
DOI:
63/227
Irena Roterman, Mateusz Banach, Leszek Konieczny.
Towards the design of anti-amyloid short peptide helices.
Bioinformation
2018 : Vol. 14, nr 1, s. 1-7, il., bibliogr. 42 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY.

p-ISSN: 0973-2063

AZ
ORG
APZ
BB: Web of Science Core Collection
Web of Science Core Collection
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
64/227
M[ateusz] Banach, L[eszek] Konieczny, I[rena] Roterman.
Why do antifreeze proteins require a solenoid?
Biochimie
2018 : Vol. 144, s. 74-84, il., bibliogr. 72 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.

p-ISSN: 0300-9084

AZ
ORG
AIF
IF: 3.362
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
65/227
Irena Roterman, Mateusz Banach, Leszek Konieczny.
Antifreeze proteins.
Bioinformation
2017 : Vol. 13, nr 12, s. 400-401, il., bibliogr. 8 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY.
Data udostępnienia w sposób otwarty: 2017-12-31

p-ISSN: 0973-2063

AZ
POG
APZ
BB: PubMed ; Web of Science Core Collection
PubMed; Web of Science Core Collection
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
66/227
Irena Roterman, Mateusz Banach, Leszek Konieczny.
Application of the Fuzzy Oil Drop Model Describes Amyloid as a Ribbonlike Micelle.
Entropy
2017 : Vol. 19, nr 4 art. no. 167, s. 1-19, il., bibliogr. 59 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
Data udostępnienia w sposób otwarty: 2017-04-14

p-ISSN: 1099-4300

AZ
ORG
AIF
IF: 2.305
BB: Scopus ; Web of Science Core Collection
Scopus; Web of Science Core Collection
Adres url:
67/227
Leszek Konieczny, Irena Roterman, Paweł Spólnik.
Biologia systemów : strategia działania organizmu żywego.
Wyd. 2, zmienione.
Warszawa : Wydawnictwo Naukowe PWN, 2017.
XIII, [1], 235 s. : il.; 24 cm.
p-ISBN: 978-83-01-19196-2

PO
POD
68/227
Magdalena Ptak, Mateusz Banach, Zdzisław Wiśniowski, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Chain-chain complexation and heme binding in haemoglobin with respect to the hydrophobic core structure.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2017 : Vol. 13, nr 4, s. 179-185, il., bibliogr. 32 poz.,a bstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
p-ISSN: 1895-9091

AP
ORG
KBN
Adres url:
69/227
M. Gadzała, B. Kalinowska, M[ateusz] Banach, L[eszek] Konieczny, I[rena] Roterman.
Determining protein similarity by comparing hydrophobic core structure.
Heliyon
2017 : Vol. 3, nr 2 art. no. e00235, s. 1-32, il., bibliogr. 64 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.
19/01/2017

p-ISSN: 2405-8440

AZ
ORG
APZ
BB: PubMed ; Scopus ; Web of Science Core Collection
PubMed; Scopus; Web of Science Core Collection
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
70/227
Anna Jagusiak, Barbara Piekarska, Tomasz Pańczyk, Małgorzata Jemioła-Rzemińska, Elżbieta Bielańska, Barbara Stopa, Grzegorz Zemanek, Janina Rybarska, Irena Roterman, Leszek Konieczny.
Dispersion of single-wall carbon nanotubes with supramolecular Congo red - properties of the complexes and mechanism of the interaction.
Beilstein Journal of Nanotechnology
2017 : Vol. 8, s. 636-648, il., bibliogr. 40 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Anna Jagusiak.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 2.0.
Data udostępnienia w sposób otwarty: 2017-03-16

p-ISSN: 2190-4286

AZ
ORG
AIF
IF: 2.968
BB: PubMed ; Scopus ; Web of Science Core Collection
PubMed; Scopus; Web of Science Core Collection
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
71/227
Barbara Kalinowska, Mateusz Banach, Zdzisław Wiśniowski, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Is the hydrophobic core a universal structural element in proteins?
Journal of Molecular Modeling
2017 : Vol. 23, nr 7 art. no. 203, s. 1-16, il., bibliogr. 43 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.

p-ISSN: 1610-2940

AZ
ORG
AIF
IF: 1.507
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
72/227
Dawid Dułak, Mateusz Banach, Zdzisław Wiśniowski, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Mechanism of ligand binding - PDZ domain taken as example.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2017 : Vol. 13, nr 4, s. 175-178, il., bibliogr. 15 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
p-ISSN: 1895-9091

AP
ORG
KBN
Adres url:
73/227
Irena Roterman, Mateusz Banach, Leszek Konieczny.
Propagation of Fibrillar Structural Forms in Proteins Stopped by Naturally Occurring Short Polypeptide Chain Fragments.
Pharmaceuticals
2017 : Vol. 10, nr 4 art. nr 89, s. 1-15, il., bibliogr. 37 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.

p-ISSN: 1424-8247

AZ
ORG
APZ
BB: PubMed ; Scopus
PubMed; Scopus
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
74/227
Maria Gołda, Mateusz Banach, Zdzisław Wiśniowski, Wojciech Ziajka, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Role of the hydrophobic core in cytoskeleton protein: cardiac myosin binding protein C.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2017 : Vol. 13, nr 3, s. 161-165, il., bibliogr. 17 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Maria Gołda.
p-ISSN: 1895-9091

AP
ORG
KBN
Adres url:
75/227
Janina Rybarska, Leszek Konieczny, Anna Jagusiak, Katarzyna Chłopaś, Grzegorz Zemanek, Barbara Piekarska, Barbara Stopa, Piotr Piwowar, Olga Woźnicka, Irena Roterman.
Silver ions as EM marker of congo red ligation sites in amyloids and amyloid-like aggregates.
Acta Biochimica Polonica
2017 : Vol. 64, nr 1, s. 161-169, il., bibliogr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY.

p-ISSN: 0001-527X

AP
ORG
AIF
IF: 1.239
BB: PubMed ; Scopus ; Web of Science Core Collection
PubMed; Scopus; Web of Science Core Collection
Adres url: *
Streszczenie w PubMed:
76/227
Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Zdzisław Wiśniowski, Irena Roterman.
Structure of hydrophobic core in plant carboxylesterase.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2017 : Vol. 13, nr 1, s. 13-16, il., bibliogr. 11 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
p-ISSN: 1895-9091

AP
ORG
KBN
Adres url:
77/227
Mateusz Banach, Zdzisław Wiśniowski, Barbara Kalinowska, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
The variability of protein structure with respect to the hydrophobic core.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2017 : Vol. 13, nr 2, s. 63-68, il., bibliogr. 21 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
p-ISSN: 1895-9091

AP
ORG
KBN
Adres url:
78/227
Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Dissimilar sequence: similar structure of proteins.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2016 : Vol. 12, nr 3, s. 117-121, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 1895-9091

AP
ORG
KBN
Adres url:
79/227
Irena Roterman, Mateusz Banach, Barbara Kalinowska, Leszek Konieczny.
Influence of the Aqueous Environment on Protein Structure - A Plausible Hypothesis Concerning the Mechanism of Amyloidogenesis.
Entropy
2016 : Vol. 18, nr 10 art. no. 351, s. 1-31, il., bibliogr. 86 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
p-ISSN: 1099-4300

AZ
ORG
AIF
IF: 1.821
Adres url:
80/227
Mateusz Banach, Barbara Kalinowska, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Role of Disulfide Bonds in Stabilizing the Conformation of Selected Enzymes-An Approach Based on Divergence Entropy Applied to the Structure of Hydrophobic Core in Proteins.
Entropy
2016 : Vol. 18, nr 3 art. no. 67, s. 1-21, il., bibliogr. 29 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
p-ISSN: 1099-4300

AZ
ORG
AIF
IF: 1.821
Adres url:
81/227
M[ateusz] Banach, B. Kalinowska, L[eszek] Konieczny, I[rena] Roterman.
Sequence-to-Structure Relation in Proteins-Amyloidogenic Proteins with Chameleon Sequences.
Journal of Proteomics and Bioinformatics
2016 : Vol. 9, nr 11, s. 264-275, il., bibliogr. 64 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY.
p-ISSN: 0974-276X

AZ
ORG
APZ
Adres url:
82/227
Jacek Dygut, Barbara Kalinowska, Mateusz Banach, Monika Piwowar, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Structural Interface Forms and Their Involvement in Stabilization of Multidomain Proteins or Protein Complexes.
International Journal of Molecular Sciences
2016 : Vol. 17, nr 10 art. no. E1741, s. 1-21, il., bibliogr. 59 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC BY 4.0.
p-ISSN: 1422-0067

AZ
ORG
AIF
IF: 3.226
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
83/227
M[ateusz] Banach, B. Kalinowska, L[eszek] Konieczny, I[rena] Roterman.
Structural Role of Hydrophobic Core in Proteins-Selected Examples.
Journal of Proteomics and Bioinformatics
2016 : Vol. 9, nr 11, s. 276-286, il., bibliogr. 41 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY.
p-ISSN: 0974-276X

AZ
ORG
APZ
Adres url:
84/227
Irena Roterman, Leszek Konieczny.
Systems biology - negative-feedback-loop based model to simulate the process in living organisms.
W: Drug Discovery & Therapy World Congress 2016 ; Global Biotechnology Congress 2016, August 22-25 2016, Boston, MA, USA : conference program and list of delegates.
s. 184 : abstr. PO-28.
SZZ
AWZ
85/227
Barbara Kalinowska, Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Application of divergence entropy to characterize the structure of the hydrophobic core in DNA interacting proteins
Entropy
2015 : Vol. 17, nr 3, s. 1477-1507, il., bibliogr. 56 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
p-ISSN: 1099-4300

AZ
ORG
AIF
IF: 1.743
Adres url:
DOI:
86/227
Jakub Wach, Marian Bubak, Leszek Konieczny, Irena Roterman-Konieczna.
Biological Systems Simulations Based on Negative Feedback.
W: CGW Workshop'15, October 26-28, 2015, Krakow, Poland : proceedings.
s. 121-122
SZP
AWZ
87/227
Irena Roterman-Konieczna, Mateusz Banach, Leszek Konieczny.
Hydrophobic core structure of macromomycin - the apoprotein of the antitumor antibiotic auromomycin - fuzzy oil drop model applied.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2015 : Vol. 11, nr 3, s. 177-181, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 1895-9091
e-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
Adres url:
DOI:
88/227
I[rena] Roterman, M[ateusz] Banach, L[eszek] Konieczny.
Hydrophobic core structure of macromomycin - the apoprotein of the antitumour antibiotic auromomycin - fuzzy oil drop model applied.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2015 : Vol. 11, nr 2, s.eA2-eA3
International Conference Cybernetic Modelling of Biological Systems MCSB 2015, Kraków (Poland), 14-15 May 2015.
p-ISSN: 1895-9091

SZM
AWZ
89/227
J. Wach, M. Bubak, L[eszek] Konieczny, I[rena] Roterman, K. Chłopaś.
Negative feedback based on simulation of bio-systems.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2015 : Vol. 11, nr 2, s. eA4
International Conference Cybernetic Modelling of Biological Systems MCSB 2015, Kraków (Poland), 14-15 May 2015.
p-ISSN: 1895-9091

SZM
AWZ
90/227
Jakub Wach, Marian Bubak, Leszek Konieczny, Irena Roterman-Konieczna.
Negative feedback based simulation of bio-systems.
W: Eighth ACC Cyfronet AGH Users' Conference : KU KDM 2015, Zakopane, 11-13 Mar 2015 : proceedings.
ed. Kazimierz Wiatr, Jacek Kitowski, Marian Bubak.
Kraków : ACC Cyfronet AGH, 2015.
s. 27-28 : il., bibliogr. 3 poz.
p-ISBN: 978-83-61433-12-5

SZM
91/227
Jakub Wach, Marian Bubak, Piotr Nowakowski, Irena Roterman, Leszek Konieczny, Katarzyna Chłopaś.
Negative feedback inhibition - Fundamental biological regulation in cells and organisms.
W: Simulations in medicine : pre-clinical and clinical applications.
(ed.) Irena Roterman-Konieczna
Berlin : De Gruyter, 2015
s. 31-56
24 cm.
p-ISBN: 978-3-11-040626-9

RMZ
ORG
RMZ
Adres url:
DOI:
92/227
K. Chłopaś, A[nna] Jagusiak, L[eszek] Konieczny, B[arbara] Piekarska, I[rena] Roterman, J[anina] Rybarska, B[arbara] Stopa, G[rzegorz] Zemanek, E. Bielańska, P. Piwowar, O. Woźnicka.
The use of metal-carrying dye markers to reveal the structure of amyloid proteins by EM.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2015 : Vol. 11, nr 2, s. eA4
International Conference Cybernetic Modelling of Biological Systems MCSB 2015, Kraków (Poland), 14-15 May 2015.
p-ISSN: 1895-9091

SZM
AWZ
93/227
Katarzyna Chłopaś, Anna Jagusiak, Leszek Konieczny, Barbara Piekarska, Irena Roterman, Janina Rybarska, Barbara Stopa, Grzegorz Zemanek, Elżbieta Bielańska, Piotr Piwowar, Krystyna Sadlik.
The use of Titan yellow dye as a metal ion binding marker for studies on the formation of specific complexes by supramolecular Congo red.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2015 : Vol. 11, nr 1, s. 9-17, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 1895-9091
e-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
Adres url:
94/227
Monika Piwowar, Jacek Dygut, Piotr Piwowar, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Attempt at a systemic outlook on aging and carcinogenesis.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2014 : Vol. 10, nr 3, s. 101-115, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 1895-9091
e-ISSN: 1896-530X

AP
POG
KBN
Adres url:
95/227
Monika Piwowar, Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Hydrophobic core formation in protein complex of cathepsin.
Journal of Biomolecular Structure & Dynamics
2014 : Vol. 32, nr 7, s. 1023-1032
p-ISSN: 0739-1102

AZ
ORG
AIF
IF: 2.919
DOI:
96/227
A[nna] Jagusiak, L[eszek] Konieczny, M[arcin] Król, P. Marszałek, B[arbara] Piekarska, P. Piwowar, I[rena] Roterman, J[anina] Rybarska, B[arbara] Stopa, G[rzegorz] Zemanek.
Intramolecular immunological signal hypothesis revived - structural background of signalling revealed by using Congo red as a specific tool.
Mini-reviews in Medical Chemistry
2014 : Vol. 14, nr 13, s. 1104-113, il., bibliogr. 63 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC 3.0.
p-ISSN: 1389-5575

AZ
ORG
AIF
IF: 2.903
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
DOI:
97/227
Barbara Kalinowska, Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Damian Marchewka, Irena Roterman.
Intrinsically disordered proteins-relation to general model expressing the active role of the water environment.
Advances in Protein Chemistry and Structural Biology
2014 : Vol. 94, s. 315-346
p-ISSN: 1876-1623

AZ
ORG
AIF
IF: 3.036
DOI:
98/227
Jakub Wach, Marian Bubak, Leszek Konieczny, Irena Roterman-Konieczna.
Negative Feedback Based Simulation of Bio-systems.
W: CGW Workshop'14, October 27-29, 2014, Krakow, Poland : proceedings.
s. 131-132.
SZP
AWZ
99/227
Irena Roterman, Mateusz Banach, Barbara Kalinowska, Leszek Konieczny.
Similar Structure - Different Stabilization - Analysis of Immunoglobulin-Like Domains.
W: 13th European Conference on Computational Biology : ECCB 2014, Strasbourg, France, 7-10 September, 2014 : program book.
SZZ
AWZ
100/227
Irena Roterman, L[eszek] Konieczny, Mateusz Banach, D. Marchewka, B. Kalinowska, Z. Baster, M. Tomanek, M[onika] Piwowar.
Simulation of the protein folding process.
W: Computational methods to study the structure and dynamics of biomolecules and biomolecular processes : from bioinformatics to molecular quantum mechanics.
ed. Adam Liwo
New York : Springer, 2014
s. 599-638
25 cm.
(Springer Series in Bio-Neuroinformatics ; vol. 1)
p-ISBN: 978-3-642-28553-0

RMZ
ORG
RMZ
DOI:
101/227
Leszek Konieczny, Irena Roterman-Konieczna, Paweł Spólnik.
Systems biology : functional strategies of living organisms.
New York : Springer, 2014
XIII, 204 s. : il.; 24 cm. - bibliogr.
p-ISBN: 978-3-319-01335-0

MZ
MON
MZ
DOI:
102/227
Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
The fuzzy oil drop model, based on hydrophobicity density distribution, generalizes the influence of water environment on protein structure and function.
Journal of Theoretical Biology
2014 : Vol. 359, s. 6-17, il., bibliogr., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 3.0.
p-ISSN: 0022-5193

AZ
ORG
AIF
IF: 2.116
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
103/227
Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman-Konieczna.
Can the structure of the hydrophobic core determine the complexation site?
W: Identification of ligand binding site and protein-protein interaction area.
ed. by Irena Roterman-Konieczna
New York : Springer, 2013
s. 41-54
Focus on Structural Biology ; Vol. 8
p-ISBN: 978-94-007-5284-9

RMZ
ORG
RMZ
DOI:
104/227
Irena Roterman, Leszek Konieczny, Mateusz Banach.
Jak ryby przeżywają stan zamrożenia?
W: Modelowanie i pomiary w medycynie : materiały XII Sympozjum, Krynica Zdrój, 19-23 maja 2013 : streszczenia referatów
pod red. Janusza Gajdy
Kraków : Wydawnictwo Katedry Metrologii i Elektroniki AGH, 2013
s. 77-78 : il., bibliogr. 5 poz.
30 cm.
p-ISBN: 978-83-61528-36-4

SZP
AWZ
105/227
Leszek Konieczny, Irena Roterman, Piotr Piwowar.
Rytmy cyrkadialne - mechanizm i znaczenie.
W: Modelowanie i pomiary w medycynie : materiały XII Sympozjum, Krynica Zdrój, 19-23 maja 2013 : streszczenia referatów
pod red. Janusza Gajdy
Kraków : Wydawnictwo Katedry Metrologii i Elektroniki AGH, 2013
s. 51-52 : il., bibliogr. 12 poz.
30 cm.
p-ISBN: 978-83-61528-36-4

SZP
AWZ
106/227
Monika Piwowar, Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Structural role of exon-coded fragment of polypeptide chains in selected enzymes.
Journal of Theoretical Biology
2013 : Vol. 337, s. 15-23, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 0022-5193

AZ
ORG
AIF
IF: 2.303
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
107/227
Monika Piwowar, Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Structural role of exon-coded fragments in proteins.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2013 : Vol. 9, nr 3, s. 103-114, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
Adres url:
DOI:
108/227
Monika Piwowar, Mateusz Banach, Leszek Konieczny, Jacques Chomilier, Irena Roterman.
Structural role of exons in hemoglobin.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2013 : Vol. 9, nr 2, s. 81-90, il., bibliogr. 21 poz., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
Adres url:
DOI:
109/227
Barbara Stopa, Anna Jagusiak, Leszek Konieczny, Barbara Piekarska, Janina Rybarska, Grzegorz Zemanek, Marcin Król, Piotr Piwowar, Irena Roterman.
The use of supramolecular structures as protein ligands.
Journal of Molecular Modeling
2013 : Vol. 19, nr 11, s. 4730-4740, il., bibliogr. 64 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY.
p-ISSN: 1610-2940
e-ISSN: 0948-5023

AZ
ORG
AIF
IF: 1.867
Adres url:
Streszczenie w PubMed:
110/227
Paweł Spólnik, Leszek Konieczny, Irena Roterman, Michalł Markiewicz.
Biological clock - is the need for a clock a common issue for cells and computers?
Bio-Algorithms and Med-Systems
2012 : Vol. 8, nr 2, s. 255-265, il., bibliogr. 37 poz., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
111/227
Mateusz Banach, Katarzyna Prymula, Wiktor Jurkowski, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Fuzzy oil drop model to interpret the structure of antifreeze proteins and their mutants.
Journal of Molecular Modeling
2012 : Vol. 18, nr 1, s. 229-237, il., bibliogr. 25 poz., abstr.
p-ISSN: 0949-183X

AZ
ORG
AIF
IF: 1.984
112/227
Irena Roterman-Konieczna, Leszek Konieczny, Janina Rybarska, Piotr Piwowar.
Rejestracja i ocena ilościowa niestabilnych białek surowicy krwi.
Pomiary, Autom., Kontr.
2012 : Vol. 58, nr 4, s. 379-382, il., bibliogr. 17 poz., abstr., streszcz.
p-ISSN: 0032-4140

AP
ORG
KBN
113/227
Leszek Konieczny, Mateusz Banach, Irena Roterman.
Stability of two natural homologous proteins with different folds.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2012 : Vol. 8, nr 2, s. 185-193, il., bibliogr. 16 poz., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
114/227
Leszek Konieczny, Michał Markiewicz, Piotr Piwowar, Irena Roterman.
Technical solutions for bio-measurements.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2012 : Vol. 8, nr 4, s. 339-349
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
115/227
Mateusz Banach, Katarzyna Prymula, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
"Fuzzy oil drop" model verified positively.
Bioinformation
2011 : Vol. 5, nr 9, s. 375-377, il., bibliogr. 14 poz., abstr.
p-ISSN: 0973-2063

AZ
ORG
APZ
116/227
Paweł Spólnik, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Biological Clock - is the Need for a Clock a Common Factor for Cells and Computers?
W: Cracow '11 Grid Workshop, Kraków, Poland, November 7-9, 2011 : abstracts
: A
: bibliogr. 5 poz.
SZP
AWZ
117/227
Paweł Spólnik, Marcin Król, Barbara Stopa, Leszek Konieczny, Barbara Piekarska, Janina Rybarska, Grzegorz Zemanek, Anna Jagusiak, Piotr Piwowar, Grzegorz Szoniec, Irena Roterman.
Influence of the electric field on supramolecular structure and properties of amyloid-specific reagent Congo red.
Eur. Biophys. J.
2011 : Vol. 40, nr 10, s. 1187-1196, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 0175-7571

AZ
ORG
AIF
IF: 2.139
118/227
Irena Roterman, Leszek Konieczny, Mateusz Banach, Wiktor Jurkowski.
Intermediates in the protein folding process : a computational model.
International Journal of Molecular Sciences
2011 : Vol. 12, nr 8, s. 4850-4860, il., bibliogr. 22 poz., abstr.
p-ISSN: 1422-0067

AZ
ORG
AIF
IF: 2.598
119/227
Barbara Stopa, Barbara Piekarska, Anna Jagusiak, Grzegorz Zemanek, Leszek Konieczny, Janina Rybarska.
Supramolecular Congo red as a potential drug carrier. Properties of Congo red-doxorubicin complexes.
Acta Biochimica Polonica
2011 : Vol. 58, supl. 2, s. 282, abstr. P28.19
2nd Congress of Biochemistry and Cell Biology 46th Meeting of the Polish Biochemical Society and 11st Conference of the Polish Cell Biology Society Kraków, Poland, September 5th - 9th, 2011
p-ISSN: 1734-154X

SZP
SIF
120/227
Paweł Spólnik, Leszek Konieczny, Barbara Piekarska, Janina Rybarska, Barbara Stopa, Grzegorz Zemanek.
The criteria of life and aging from a molecular viewpoint. The role of protein aggregation in the process of aging.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2011 : Vol. 7, nr 1, s. 23-30, il., bibliogr. 36 poz., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
POG
KBN
121/227
I[rena] Roterman, L[eszek] Konieczny, W[iktor] Jurkowski, K. Prymula, M[ateusz] Banach.
Two-intermediate model to characterize the structure of fast-folding proteins.
Journal of Theoretical Biology
2011 : Vol. 283, nr 1, s. 60-70, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 0022-5193

AZ
ORG
AIF
IF: 2.208
122/227
Leszek Konieczny, Irena Roterman, Paweł Spólnik.
Biologia systemów : strategia działania organizmu żywego.
Warszawa : Wydawnictwo Naukowe PWN, 2010
XI : 215, [1] s. : il. ; 24 cm.
p-ISBN: 978-83-01-16392-1

PO
ORG
MP
123/227
Barbara Stopa, Barbara Piekarska, Leszek Konieczny, Marcin Król, Janina Rybarska, Anna Jagusiak, Paweł Spólnik, Irena Roterman, Barbara Urbanowicz, Piotr Piwowar, Krzysztof Lewiński.
Formation of amyloid-like aggregates through the attachment of protein molecules to a Congo red scaffolding framework ordered under the influence of an electric field.
Central European Journal of Chemistry
2010 : Vol. 8, nr 1, s. 41-50, il., bibliogr. 63 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 0.991
124/227
Leszek Konieczny, Irena Roterman, Paweł Spólnik.
New challenges in computational biology.
W: Cracow '10 Grid Workshop, Kraków, Poland, October 11-13, 2010 : abstracts.
SZP
AWZ
125/227
Irena Roterman, Michal Brylinski, Leszek Konieczny.
Active site recognition in silico.
W: Structure-function relation in proteins / ed. Irena Roterman.
Trivandrum : Transworld Research Network, 2009
s. 105-127 : il., bibliogr. 67 poz., abstr.
RMZ
ORG
RMZ
126/227
Leszek Konieczny, Paweł Spólnik, Irena Roterman.
Detektory biologiczne.
W: Modelowanie i pomiary w medycynie : materiały IX sympozjum : Krynica,10-14 maja 2009 r. / pod red. Janusza Gajdy.
Kraków : Wydawnictwo Katedry Metrologii AGH, 2009
s. 45-46 : il., bibliogr. 2 poz.
RZP
ORG
RMP
127/227
Irena Roterman, Leszek Konieczny, Michal Brylinski.
Folding process in the presence of specific ligand.
W: Structure-function relation in proteins / ed. Irena Roterman.
Trivandrum : Transworld Research Network, 2009
s. 129-148 : il., bibliogr. 26 poz., abstr.
RMZ
ORG
RMZ
128/227
Irena Roterman, Leszek Konieczny, Michal Brylinski.
Late stage folding intermediate in silico model.
W: Structure-function relation in proteins / ed. Irena Roterman.
Trivandrum : Transworld Research Network, 2009
s. 79-103 : il., bibliogr. 48 poz., abstr.
RMZ
ORG
RMZ
129/227
Barbara Piekarska, Anna Jagusiak, Leszek Konieczny.
Binding of Congo red to antibodies and its effect on the interaction with C1q.
Acta Biochimica Polonica
2008 : Vol. 55 suppl. 3, s. 111, abstr. P5.51
The Congress of Biochemistry and Cell Biology, 43rd Meeting of the Polish Biochemical Society and 10th Conference of Polish Cell Biology Society, Olsztyn, Poland, September 7th-11st, 2008.
SZP
SIF
130/227
Barbara Stopa, Janina Rybarska, Leszek Konieczny.
Binding of self-assembling dyes to albumin.
Acta Biochimica Polonica
2008 : Vol. 55 suppl. 3, s. 110, abstr. P5.50
The Congress of Biochemistry and Cell Biology, 43rd Meeting of the Polish Biochemical Society and 10th Conference of Polish Cell Biology Society, Olsztyn, Poland, September 7th-11st, 2008.
SZP
SIF
131/227
Michal Brylinski, Leszek Konieczny, Andrzej Kononowicz, Irena Roterman.
Conservative secondary structure motifs already present in early-stage folding (in silico) as found in serpines family.
Journal of Theoretical Biology
2008 : Vol. 251, nr 2, s. 275-285, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 0022-5193

AZ
ORG
AIF
IF: 2.454
132/227
Michal Brylinski, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Is the protein folding an aim-oriented process? Human haemoglobin as example.
Int. J. Bioinformatics Res. Appl.
2007 : Vol. 3, nr 2, s. 234-260, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
APZ
Adres url:
133/227
Michał Bryliński, Katarzyna Prymula, Wiktor Jurkowski, Marek Kochańczyk, Ewa Stawowczyk, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Prediction of functional sites based on the fuzzy oil drop model.
PLoS Comput. Biol.
2007 : Vol. 3, nr 5, s. 909-923, il., bibliogr. 80 poz.
p-ISSN: 1553-734X

AZ
ORG
AIF
IF: 6.236
Adres url:
134/227
Anna Drozd, Barbara Piekarska, Leszek Konieczny, Marcin Krol, Wiktor Jurkowski, Irena Roterman, Barbara Stopa, Janina Rybarska.
The long-distance structural Ganges in antibodies. Studies by Congo red binding and molecular modeling.
Acta Biochimica Polonica
2007 : Vol. 54 suppl. 2, s. 13, abstr. P1.10
6th Parnas Conference Molecular Mechanism of Cellular Signalling, Kraków, Poland, May 30th - June 2nd, 2007.
SZP
SIF
135/227
Paweł Spólnik, Barbara Stopa, Barbara Piekarska, Anna Jagusiak, Leszek Konieczny, Janina Rybarska, Marcin Król, Irena Roterman, Barbara Urbanowicz, Janina Zięba-Palus.
The Use of Rigid, Fibrillar Congo Red Nanostructures for Scaffolding Protein Assemblies and Inducing the Formation of Amyloid-like Arrangement of Molecules.
Chemical Biology & Drug Design
2007 : Vol. 70, nr 6, s. 491-501, il., bibliogr. 66 poz.
p-ISSN: 1747-0277

AZ
ORG
AIF
IF: 2.043
Adres url:
136/227
Jan Meus, Michał Brylinski [Bryliński], Monika Piwowar, Piotr Piwowar, Zdzisław Wiśniowski, Justyna Stefaniak, Leszek Konieczny, Grzegorz Surówka, Irena Roterman.
A tabular approach to the sequence-to-structure relation in proteins (tetrapeptide representation) for de novo protein design.
Medical Science Monitor
2006 : Vol. 12, nr 6, s. BR208-214, il., bibliogr. 44 poz., summ.
AP
ORG
AIF
IF: 1.595
Adres url:
137/227
Barbara Stopa, Janina Rybarska, Anna Drozd, Leszek Konieczny, Marcin Król, Marek Lisowski, Barbara Piekarska, Irena Roterman, Paweł Spólnik, Grzegorz Zemanek.
Albumin binds self-assembling dyes as specific polymolecular ligands.
International Journal of Biological Macromolecules
2006 : Vol. 40, nr 1, s. 1-8, il., bibliogr. 52 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 1.323
138/227
Michal Brylinski, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Fuzzy-oil-drop hydrophobic force field--a model to represent late-stage folding (in silico) of lysozyme.
Journal of Biomolecular Structure & Dynamics
2006 : Vol. 23, nr 5, s. 519-528, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 1.299
Adres url:
139/227
Leszek Konieczny, Michal Brylinski, Irena Roterman.
Gauss-function-based model of hydrophobicity density in proteins.
In Silico Biol.
2006 : Vol. 6, nr 1-2, s. 15-22, il., bibliogr. 36 poz., abstr.
AZ
ORG
APZ
Adres url:
140/227
Anna Drozd, Leszek Konieczny, Barbara Piekarska, Janina Rybarska, Barbara Stopa, Grzegorz Zemanek.
How specially adapted chromatographic bed material might be used for the controlled formation of immune complexes and studies of Congo Red binding to bivalent nntibodies.
Bio-Algorithms and Med-Systems
2006 : Vol. 2, nr 4, s. 25-28, il, bibliogr. 15 poz., abstr., streszcz.
AP
ORG
Adres url:
141/227
Michal Brylinski, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Hydrophobic collapse in (in silico) protein folding.
Comput. Biol. Chem.
2006 : Vol. 30, nr 4, s. 255-267, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 2.135
142/227
Michal Brylinski, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Hydrophobic collapse in late-stage folding (in silico) of bovine pancreatic trypsin inhibitor.
Biochimie
2006 : Vol. 88, nr 9, s. 1229-1239, il., bibliogr. 91 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 3.237
Adres url:
143/227
Michal [Michał] Brylinski [Bryliński], Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Ligation site in proteins recognized in silico.
Bioinformation
2006 : Vol. 1, nr 4, s. 127-129, il., bibliogr. 17 poz., abstr.
AZ
ORG
APZ
Adres url:
144/227
Michal [Michał] Brylinski [Bryliński], Marek Kochanczyk, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Sequence-structure-function relation characterized in silico.
In Silico Biol.
2006 : Vol. 6, nr 6, s. 589-600, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
APZ
Adres url:
145/227
Marcin Krol, Irena Roterman, Anna Drozd, Leszek Konieczny, Barbara Piekarska, Janina Rybarska, Pawel Spolnik, Barbara Stopa.
The increased flexibility of CDR loops generated in antibodies by Congo red complexation favors antigen binding.
Journal of Biomolecular Structure & Dynamics
2006 : Vol. 23, nr 4, s. 407-416, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 1.299
Adres url:
146/227
Barbara Piekarska, Anna Drozd, Leszek Konieczny, Marcin Król, Wiktor Jurkowski, Irena Roterman, Paweł Spólnik, Barbara Stopa, Janina Rybarska.
The indirect generation of long-distance structural changes in antibodies upon their binding to antigen.
Chemical Biology & Drug Design
2006 : Vol. 68, nr 5, s. 276-283, il., bibliogr. 61 poz.
AZ
ORG
APZ
Adres url:
147/227
Paweł Spólnik, Leszek Konieczny, Barbara Piekarska, Janina Rybarska, Barbara Stopa, Grzegorz Zemanek, Anna Drozd, Marcin Król, Irena Roterman, Teresa Wolska-Smoleń, Aleksander B[artłomiej] Skotnicki.
The use of the Congo red-related dye DBACR to recognize the heavy chain-derived abnormality of myeloma immunoglobulins.
Archivum Immunologiae et Therapiae Experimentalis
2006 : Vol. 54, nr 3, s. 217-221, il., bibliogr. 18 poz., abstr.
AP
ORG
AIF
IF: 1.635
Adres url:
148/227
Marcin Król, Irena Roterman, Barbara Piekarska, Leszek Konieczny, Janina Rybarska, Barbara Stopa, Paweł Spólnik, Edward Szneler.
An approach to understand the complexation of supramolecular dye Congo red with immunoglobulin L chain λ.
Biopolymers
2005 : Vol. 77, nr 3, s. 155-162, il., bibliogr. 28 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 2.545
Adres url:
149/227
Marcin Król, Irena Roterman, Barbara Piekarska, Leszek Konieczny, Janina Rybarska, Barbara Stopa, Paweł Spólnik.
Analysis of correlated domain motions in IgG light chain reveals possible mechanisms of immunological signal transduction.
Proteins
2005 : Vol. 59, nr 3, s. 545-554, il., bibliogr. 71 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 4.684
Adres url:
150/227
Michal Brylinski, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
CASP6 - our best approach.
W: VIth European Symposium of the Protein Society, Barcelona, 30 April - 4 May, 2005 : final program and abstracts
s. 94 : abstr. 05-5.
SZZ
AWZ
151/227
Irena Roterman, Leszek Konieczny, Michal Brylinski.
CASP6 - our worst approach.
W: VIth European Symposium of the Protein Society, Barcelona, 30 April - 4 May, 2005 : final program and abstracts
s. 94 : abstr. 05-6.
SZZ
AWZ
152/227
Michal Brylinski, Leszek Konieczny, Patryk Czerwonko, Wiktor Jurkowski, Irena Roterman.
Early-stage folding in proteins (in silico) sequence-to-structure relation.
J. Biomed. Biotechnol.
2005 : Vol. 2005, nr 2, s. 65-79, il., bibliogr. 80 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 1.812
Adres url:
153/227
Anna Drozd, Leszek Konieczny, Janina Rybarska, Barbara Stopa, Barbara Piekarska, Irena Roterman, Marcin Król, Paweł Spólnik, Grzegorz Zemanek.
Kompleksy białek i układów ciekłokrystalicznych. Możliwość zastosowań praktycznych.
(Specific supramolecular ligands with proteins. Possible practical application.)
Bio-Algorithms and Med-Systems
2005 : Vol. 1, nr 1-2, s. 113-116, il., bibliogr. 28 poz., abstr., streszcz.
AP
POG
Adres url:
154/227
Wiktor Jurkowski, Irena Roterman, Leszek Konieczny.
Protein active site in the early-stage folding structure.
W: VIth European Symposium of the Protein Society, Barcelona, 30 April - 4 May, 2005 : final program and abstracts
s. 94 : abstr. 05-8.
SZZ
AWZ
155/227
Michał Bryliński, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
SPI - Structure predictability index for protein sequences.
In Silico Biol.
2005 : Vol. 5, nr 3, s. 227-237, il., bibliogr. 45 poz., abstr.
AZ
ORG
APZ
Adres url:
156/227
Janina Rybarska, Paweł Spólnik, Anna Drozd, Leszek Konieczny, Barbara Piekarska, Barbara Stopa, Grzegorz Zemanek, Marcin Król, Irena Roterman-Konieczna.
Tworzenie i rozdział kompleksów białek surowicy z barwnikami supramolekularnymi w elektroforezie dwukierunkowej - próba opracowania komputerowej techniki analizy obrazu rozdziałowego.
(Protein complexes with supramolecular ligands formed and revealed in two-dimensional electrophoresis. The search for computer analysis of results.)
Bio-Algorithms and Med-Systems
2005 : Vol. 1, nr 1-2, s. 133-138, il., bibliogr. 40 poz., abstr., streszcz.
AP
POG
Adres url:
157/227
Wiktor Jurkowski, Michał Brylinski, Leszek Konieczny, Zdzisław Wiiniowski [Wiśniowski], Irena Roterman.
Conformational subspace in simulation of early-stage protein folding.
Proteins
2004 : Vol. 55, nr 1, s. 115-127, il., bibliogr. 35 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 4.429
Adres url:
158/227
Marcin Król, Tomasz Borowski, Irena Roterman, Barbara Piekarska, Barbara Stopa, Joanna Rybarska, Leszek Konieczny.
Force-field parametrization and molecular dynamics simulations of Congo red.
Journal of Computer-Aided Molecular Design
2004 : Vol. 18, nr 1, s. 41-53, il., bibliogr. 41 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 2.729
159/227
Janina Rybarska, Barbara Piekarska, Barbara Stopa, Paweł Spólnik, Grzegorz Zemanek, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
In vivo accumulation of self-assembling dye Congo red in an area marked by specific immune complexes : possible relevance to chemotherapy.
Folia Histochemica et Cytobiologica
2004 : Vol. 42, nr 2, s. 101-110, il., bibliogr. 48 poz., abstr.
AP
ORG
AIF
IF: 0.672
Adres url:
160/227
Paweł Spólnik, Leszek Konieczny, Barbara Piekarska, Janina Rybarska, Barbara Stopa, Grzegorz Zemanek, Marcin Król, Irena Roterman.
Instability of monoclonal myeloma protein may be identified as susceptibility to penetration and binding by newly synthesized Congo red derivatives.
Biochimie
2004 : Vol. 86, nr 6, s. 397-402, il., bibliogr. 10 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 3.814
Adres url:
161/227
B[arbara] Piekarska, L[eszek] Konieczny, J. Rybarska, B[arbara] Stopa, P[aweł] Spólnik, I[rena] Roterman, M[arcin] Król.
Intramolecular signaling in immunoglobulins - new evidence emerging from the use of supramolecular protein ligands.
Journal of Physiology and Pharmacology
2004 : Vol. 55, nr 3, s. 487-501, il., bibliogr. 83 poz.
AP
POG
AIF
IF: 2.328
Adres url:
162/227
Michał Bryliński, Wiktor Jurkowski, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Limitation of conformational space for proteins - early stage holding simulation of human α and β hemoglobin chains.
T.A.S.K. Q.
2004 : Vol. 8, nr 3, s. 413-422, bibliogr.
AP
ORG
KBN
163/227
M[ichał] Bryliński, W[iktor] Jurkowski, L[eszek] Konieczny, I[rena] Roterman.
Limited conformational space for early-stage protein folding simulation.
Bioinformatics
2004 : Vol. 20, nr 2, s. 199-205, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 5.742
Adres url:
164/227
W[iktor] Jurkowski, M[ichał] Bryliński, L[eszek] Konieczny, I[rena] Roterman.
Lysozyme folded in silico according to the limited conformational sub-space.
Journal of Biomolecular Structure & Dynamics
2004 : Vol. 22, nr 2, s. 149-158, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 1.113
Adres url:
165/227
B[arbara] Piekarska, B[arbara] Stopa, L[eszek] Konieczny, J[anina] Rybarska, G[rzegorz] Zemanek, P[aweł] Spólnik, I[rena] Roterman, M[arcin] Król.
The immunological signal revisited : new evidence emerging from the use of supramolecular protein ligands.
Eur. J. Biochem.
2004 : Vol. 271 suppl. 1, s. 96, abstr. P3.3-21
29th Meeting of the Federation of the European Biochemical Societies, Warsaw, 26 June-1 July 2004.
SZM
SIF
166/227
M. Nowak, I[rena] Roterman, L[eszek] Konieczny, B[arbara] Piekarska, J[anina] Rybarska, B[arbara] Stopa.
BPTI transformed to amyloid form in vitro and in silico.
Protein Sci.
2003 : Vol. 12 suppl. 1, s. 186, abstr. 460
Fifth European Symposium of the Protein Society, Italy, Florence, March 29 - April 2, 2003
SZZ
SIF
167/227
I[rena] Roterman, J. Leluk, L[eszek] Konieczny.
Characteristics of repetitive DNA sequences in mouse genome.
Protein Sci.
2003 : Vol. 12 suppl. 1, abstr. 383
Fifth European Symposium of the Protein Society, Italy, Florence, March 29 - April 2, 2003
SZZ
SIF
168/227
B[arbara] Stopa, L[eszek] Konieczny, J[anina] Rybarska, S. Pawel, B[arbara] Piekarska, I[rena] Roterman.
Complexation properties of some Congo red related and nonrelated dyes : structural characteristics of amyloid-specific reagents.
Protein Sci.
2003 : Vol. 12 suppl. 1, s. 185, abstr. 457
Fifth European Symposium of the Protein Society, Italy, Florence, March 29 - April 2, 2003
SZZ
SIF
169/227
Michał Zwiewka, Anna Barczak, Yuriy Antoniv, Leszek Konieczny opiekun, Dorota Gil opiekun.
Czerniak złośliwy - ogólna charakterystyka, terapia i wpływ interleukiny-6, jako wstęp do problematyki badania jej wpływu na N-kadheryny w jego błonie komórkowej.
Przegląd Lekarski
2003 : T. 60 supl. 2, s. 45, abstr. 181
XLI Ogólnopolska i VII Międzynarodowa Konferencja Studentów Medycyny, Kraków 2003.
SZM
AWZ
Adres url:
170/227
Marcin Król, Irena Roterman, Barbara Piekarska, Barbara Stopa, Joanna Rybarska, Leszek Konieczny.
Functionally induced structural changes in immunoglobulin G domains registered by liquid crystal ligand binding - a computer simulation.
W: Proceedings of the European Conference on Computational Biology in conjuncton with the French National Conference on Bioinformatics (JOBIM 2003) ECCB'2003 / edited by Catherine Christophe, Hans-Peter Lenhof, Marie-France Sagot, Paris, France, Sept.
s. 225- : PS-33
RZZ
APZ
171/227
W[iktor] Jurkowski, Z[dzisław] Wisniowski, L[eszek] Konieczny, I[rena] Roterman.
Limitation of conformational space for early stage of protein folding simulation.
Protein Sci.
2003 : Vol. 12 suppl. 1, s. 163, abstr. 382
Fifth European Symposium of the Protein Society, Italy, Florence, March 29 - April 2, 2003
SZZ
SIF
172/227
Marcin Król, Irena Roterman, Barbara Piekarska, Leszek Konieczny, Janina Rybarska, Barbara Stopa.
Local and long-range structural effects caused by the removal of the N-terminal polypeptide fragment from immunoglobulin L chain λ.
Biopolymers
2003 : Vol. 69, nr 2, s. 189-200, il., bibliogr. 57 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 2.733
173/227
Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Nowotwory - struktura czy organizacja?
(Cancers - structure or organization?)
Menopauza
2003 : T. 2, z. 3, s. 87-91, il., bibliogr. 32 poz., streszcz., abstr.
AP
POG
KBN
Adres url:
174/227
Grzegorz Zemanek, Janina Rybarska, Barbara Stopa, Barbara Piekarska, Paweł Spólnik, Leszek Konieczny, Irena Roterman, Andrzej Bugajski.
Protein distorsion-derived mechanism of signal discrimination in monocytes revealed using Congo red to stain activated cells.
Folia Histochemica et Cytobiologica
2003 : Vol. 41, nr 3, s. 113-124, il., bibliogr. 40 poz., abstr.
AP
ORG
AIF
IF: 0.475
Adres url:
175/227
B[arbara] Piekarska, L[eszek] Konieczny, J[anina] Rybarska, G[rzegorz] Zemanek, M. Krol, M. Nowak, I[rena] Roterman.
Role of N-terminal fragment of immunoglobulin light chain Lambda in the stability of the protein (Domain) - Experimental studies on protein-Congo red complexes.
Protein Sci.
2003 : Vol. 12 suppl. 1, s. 186, abstr. 458
Fifth European Symposium of the Protein Society, Italy, Florence, March 29 - April 2, 2003
SZZ
AIF
176/227
M. Krol, I[rena] Roterman, B[arbara] Piekarska, L[eszek] Konieczny, J[anina] Rybarska, B[arbara] Stopa.
Role of N-terminal fragment of immunoglobulin light chain Lambda in the stability of the protein (Domain) - theoretical studies on protein-Congo red complexes.
Protein Sci.
2003 : Vol. 12 suppl. 1, s. 186, abstr. 459
Fifth European Symposium of the Protein Society, Italy, Florence, March 29 - April 2, 2003
SZZ
SIF
177/227
Jacek Leluk, Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Search for structural similarity in proteins.
Bioinformatics
2003 : Vol. 19, nr 1, s. 117-124, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 6.701
Adres url:
178/227
Paweł Spólnik, Barbara Piekarska, Barbara Stopa, Leszek Konieczny, Grzegorz Zemanek, Janina Rybarska, Marcin Król, Mateusz Nowak, Irena Roterman.
The structural abnormality of myeloma immunoglobulins tested by Congo red binding.
Medical Science Monitor
2003 : Vol. 9, nr 4, s. BR145-BR153, il., bibliogr. 60 poz., summ.
AP
ORG
KBN
Adres url:
179/227
P[aweł] Spolnik, J[anina] Rybarska, L[eszek] Konieczny, B[arbara] Piekarska, B[arbara] Stopa, G[rzegorz] Zemanek, M. Krol, M. Nowak, I[rena] Roterman.
The structural abnormality of myeloma immunoglobulins tested by Congo red binding.
Protein Sci.
2003 : Vol. 12 suppl. 1, s. 187, abstr. 461
Fifth European Symposium of the Protein Society, Italy, Florence, March 29 - April 2, 2003
SZZ
SIF
180/227
Barbara Stopa, Barbara Piekarska, Leszek Konieczny, Janina Rybarska, Paweł Spólnik, Grzegorz Zemanek, Irena Roterman, Marcin Król.
The structure and protein binding of amyloid-specific dye reagents.
Acta Biochimica Polonica
2003 : Vol. 50, nr 4, s. 1213-1227, il., bibliogr.
AP
ORG
AIF
IF: 0.629
Adres url:
181/227
Grzegorz Zemanek, Leszek Konieczny, Barbara Piekarska, Janina Rybarska, Barbara Stopa, Paweł Spólnik, Barbara Urbanowicz, Mateusz Nowak, Marcin Król, Irena Roterman.
Egg yolk platelet proteins from Xenopus laevis are amyloidogenic.
Folia Histochemica et Cytobiologica
2002 : Vol. 40, nr 3, s. 311-318, il., bibliogr. 39 poz., abstr.
AP
ORG
AIF
IF: 0.526
Adres url:
182/227
Marcin Król, Mateusz Nowak, Irena Roterman, Barbara Piekarska, Janina Rybarska, Barbara Stopa, Grzegorz Zemanek, Leszek Konieczny.
Interaction of immunoglobulin light chain dimer with Congo red - dynamics study.
W: XIV International Biophysics Congress, Buenos-Aires, April 27-May 1, 2002 : book of abstracts.
SZZ
AWZ
183/227
Janina Rybarska, Barbara Piekarska, Barbara Stopa, Grzegorz Zemanek, Leszek Konieczny, Mateusz Nowak, Marcin Król, Irena Roterman, Agnieszka Szymczakiewicz-Multanowska.
Evidence that supramolecular Congo red is the sole ligation form of this dye for L chain λ derived amyloid proteins.
Folia Histochemica et Cytobiologica
2001 : Vol. 39, nr 4, s. 307-314, il., bibliogr. 41 poz., abstr.
AP
AIF
IF: 0.594
Adres url:
184/227
B[arbara] Piekarska, L[eszek] Konieczny, J[anina] Rybarska, B[arbara] Stopa, G[rzegorz] Zemanek, E. Szneler, M[arcin] Król, M. Nowak, I[rena] Roterman.
Heat-induced formation of a specific binding site for self-assembled Congo Red in the V domain of immunoglobulin L chain λ.
Biopolymers
2001 : Vol. 59, s. 446-456, il., bibliogr. 61 poz., abstr.
AZ
AIF
IF: 1.845
185/227
Marcin Król, Mateusz Nowak, Irena Roterman, Barbara Stopa, Barbara Piekarska, Joanna Rybarska, Leszek Konieczny.
Interaction of immunoglobulin light chain dimer with Congo red - dynamics study.
W: The Protein Society Fourth European Symposium, Paris, France, 18 - 22 April, 2001 : program and abstracts
s. 95 : abstr. 181.
SZZ
AWZ
186/227
Mateusz Nowak, Marcin Król, Irena Roterman, Leszek Konieczny, Janina Rybarska, Barbara Stopa, Barbara Piekarska, Grzegorz Zemanek.
Is the molecular dynamics simulation able to predict the amyloid formation?
W: The 1st Summer School on Parallel Computing in Biomolecular Simulations, Gdansk, Poland, September 1 - September 3, 2001 : program and abstracts
abstr. P-8 : bibliogr. 5 poz.
SZP
AWZ
187/227
Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Jak ograniczać biochemię nauczaną nie ograniczając nauczania?
(How to limit biochemistry without limiting teaching ?)
W: XXXVII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego, Toruń, 10-14 września 2001
s. 258 : abstr. W-13-06.
SZP
AWZ
188/227
I[rena] Roterman, M. Nowak, M[arcin] Król, L[eszek] Konieczny, J. Rybarska, B[arbara] Stopa, B[arbara] Piekarska, G[rzegorz] Zemanek.
Limitations in molecular dynamics simulations.
W: The 1st Summer School on Parallel Computing in Biomolecular Simulations, Gdansk, Poland, September 1 - September 3, 2001 : program and abstracts
abstr. L-12 : bibliogr. poz.
SZP
AWZ
189/227
Leszek Konieczny, Barbara Piekarska, Irena Roterman, Janina Rybarska, Barbara Stopa, Grzegorz Zemanek.
Przeciwciała i nośniki leków w terapii celowanej - postęp i ograniczenia.
Biotechnologia
2001 : nr 3, s. 37-52, summ.
AP
KBN
Adres url:
190/227
J[anina] Rybarska, B[arbara] Stopa, B[arbara] Piekarska, G[rzegorz] Zemanek, L[eszek] Konieczny, M[arcin] Król, M. Nowak, I[rena] Roterman.
Supramolekularna czerwień Kongo jest ligandem dla białek amyloidowych.
(Supramolecular Congo red is a ligand for amyloid proteins.)
W: XXXVII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego, Toruń, 10-14 września 2001
s. 131-132 : abstr. K-07-03.
SZP
AWZ
191/227
Mateusz Nowak, Marcin Król, Irena Roterman, Barbara Stopa, Barbara Piekarska, Joanna Rybarska, Leszek Konieczny.
The effect of point mutations on amyloidogenicity of monoclonal immunoglobulin light chain. The computational approach.
W: The Protein Society Fourth European Symposium, Paris, France, 18 - 22 April, 2001 : program and abstracts
s. 95 : abstr. 180.
SZZ
AWZ
192/227
Irena Roterman, Marcin Król, Mateusz Nowak, Leszek Konieczny, Janina Rybarska, Barbara Stopa, Barbara Piekarska, Grzegorz Zemanek.
Why Congo red binding is specific for amyloid proteins - model studies and a computer analysis approach.
Medical Science Monitor
2001 : Vol. 7, nr 4, s. 771-784, il., bibliogr. 36 poz., summ.
AP
KBN
Adres url:
193/227
G[rzegorz] Zemanek, J[anina] Rybarska, B[arbara] Stopa, B[arbara] Piekarska, L[eszek] Konieczny, M. Król, M[ateusz] Nowak, I[rena] Roterman.
Wiązanie ligandów supramolekularnych do receptorów komórkowych.
(Supramolecular ligands bound to cell receptors.)
W: XXXVII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego, Toruń, 10-14 września 2001
s. 140 : abstr. P-07-08.
SZP
AWZ
194/227
Barbara Piekarska, Leszek Konieczny, Irena Roterman, Janina Rybarska, Barbara Stopa, Grzegorz Zemanek, Marcin Król, Mateusz Nowak.
Zmiany konformacyjne w cząsteczce immunoglobuliny G wywołane tworzeniem kompleksu z antygenem jako sygnał wyzwalający aktywność efektorową przeciwciała.
(Conformational changes in IgG induced by the complex creation with Congo red as the signal inducing the effector activity in antibody.)
W: XXXVII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego, Toruń, 10-14 września 2001
s. 141 : abstr. P-07-10.
SZP
AWZ
195/227
Barbara Piekarska, Leszek Konieczny, Irena Roterman, Marcin Król, Janina Rybarska, Barbara Stopa.
Kompleks łańcucha lekkiego (lambda) immunoglobuliny z supramolekularnym ligandem - czerwienią Kongo.
W: XXXVI Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego, Poznań 2000 : streszczenia
s. 120-121 : abstr. PO5-57.
SZP
196/227
Irena Roterman, Leszek Konieczny, Marcin Król, Mateusz Nowak, Janina Rybarska, Barbara Piekarska, Barbara Stopa, Grzegorz Zemanek.
Monomeryczna i supramolekularna forma czerwieni Kongo w kompleksach z białkami.
W: XXXVI Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego, Poznań 2000 : streszczenia
s. 136 : abstr. PO5-92.
SZP
197/227
Leszek Konieczny, Irena Roterman.
Strategia działania organizmu żywego.
(The strategy of living organism.)
Kraków : Zamiast Korepetycji, 2000
144 s. : il., bibliogr.
p-ISBN: 83-85434-80-1

MP
ORG
MP
198/227
M. Skowronek, I[rena] Roterman, L[eszek] Konieczny, B[arbara] Stopa, J[anina] Rybarska, B[arbara] Piekarska, A. Górecki, M[arcin] Król.
The conformational characteristics of Congo red, Evans blue and Trypan blue.
Comput. Chem.
2000 : Vol. 24, nr 3-4, s. 429-450, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 0.926
Adres url:
199/227
Leszek Konieczny, Janina Rybarska, Barbara Stopa, Barbara Piekarska, Grzegorz Zemanek, Marcin Król, Mateusz Nowak, Irena Roterman.
Układy ciekłokrystaliczne jako potencjalne nośniki leków w technice immunotargetingu.
W: XXXVI Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego, Poznań 2000 : streszczenia
s. 234 : abstr. PO9-44.
SZP
200/227
M. Skowronek, I[rena] Roterman, L[eszek] Konieczny, B[arbara] Stopa, J[anina] Rybarska, B[arbara] Piekarska.
Why do Congo Red, Evans Blue, and Trypan Blue differ in their complexation properties?
J. Comput. Chem.
2000 : Vol. 21, nr 8, s. 656-667, il., bibliogr. 32 poz., abstr.
AZ
ORG
IF: 2.990
201/227
Irena Roterman, Leszek Konieczny, Janina Rybarska, Barbara Piekarska, Barbara Stopa.
Congo red bound to β-structural polypeptide chains. (Wiązanie czerwieni Kongo do łańcuchów polipeptydowych o konformacji b).
Protein Sci.
1999 : Vol. 8 suppl. 1, s. 117, abstr. 358-M
Thirteenth Symposium of the Protein Society, Boston, MA, July 24-28, 1999.
SZZ
SIF
202/227
Irena Roterman, Leszek Konieczny, Janina Rybarska, Barbara Piekarska, Barbara Stopa.
Congo red bound to β-structural polypeptide chains. (Wiązanie czerwieni Kongo do łańcuchów polipeptydowych o konformacji b).
Protein Sci.
1999 : Vol. 8 suppl. 2
Third European Symposium of the Protein Society, Garmisch-Partenkirchen, 19-22 September, 1999.
AZ
AIF
IF: 4.457
203/227
I[rena] Roterman, L[eszek] Konieczny, J[anina] Rybarska, B[arbara] Stopa, B[arbara] Piekarska, M[agdalena] Górny, M[arcin] Król.
Dokowanie ligandu ciekłokrystalicznego czerwieni Kongo do białek - zastosowanie praktyczne.
(Supramolecular Congo red ligand docking to proteins - practical application.)
W: I Krajowy Kongres Biotechnologii, Wrocław, 20-25 września 1999 : referaty
s. 202-203 : il.
SZP
204/227
M[arek] Skowronek, I[rena] Roterman, L[eszek] Konieczny, B[arbara] Stopa, J[anina] Rybarska, B[arbara] Piekarska, A. Górecki, M[arcin] Król.
The structure of Congo Red, Evans Blue and Trypan Blue as seen in calculation using different methods. (Struktura czerwieni Kongo, błękitu Evansa i błękitu Trypanu wyznaczona z wykorzystaniem różnych pól siłowych).
W: 5th International Conference Computers in chemistry '99 and Polish-American Workshop New trends in computational methods for large molecular systems, Szklarska Poręba, Poland, July 1-6, 1999 : program and abstracts
s. P67.
SZP
205/227
I[rena] Roterman, J[anina] Rybarska, L[eszek] Konieczny, M[arek] Skowronek, B[arbara] Stopa, B[arbara] Piekarska, G. Bakalarski.
Congo Red Bound To alfa-1-Proteinase Inhibitor as a Model of Supramolecular Ligand and Protein Complex.
Comput. Chem.
1998 : Vol. 22, nr 1, s. 61-70, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 1.566
Adres url:
206/227
I[rena] Roterman, M. Skowronek, L[eszek] Konieczny, B[arbara] Stopa, J[anina] Rybarska, B[arbara] Piekarska, M[agdalena] Górny.
Liquid crystals as supramolecular ligands. (Ciekłe kryształy, jako ligandy supramolekularne).
W: Annual Conference of the HP2EUG.
SZZ
207/227
M. Skowronek, B[arbara] Stopa, L[eszek] Konieczny, J[anina] Rybarska, B[arbara] Piekarska, E. Szneler, G. Bakalarski, I[rena] Roterman.
Self-Assembly of Congo Rad - A Theorethical and Experimental Appropach to Identify Its Supramolecular Organization in Water and Salt Solution.
Biopolymers
1998 : Vol.46, s. 267-281.
AZ
AIF
IF: 2.086
208/227
B[arbara] Stopa, M[agdalena] Górny, L[eszek] Konieczny, B[arbara] Piekarska, J[anina] Rybarska, M[arek] Skowronek, I[rena] Roterman.
Supramolecular ligands : Monomer structure and protein ligation capability.
Biochimie
1998 : Vol. 80, nr 12, s. 963-968, il., bibliogr. 29 poz., abstr.
AZ
AIF
IF: 1.617
Adres url:
209/227
Irena Roterman, Marek Skowronek, Leszek Konieczny, Janina Rybarska, Barbara Stopa, Barbara Piekarska.
Computer aided drug design.
W: HiPer '97 - High Performance Computing on Hewlett-Packard Systems, Kraków, Poland, November 5-8, 1997 : conference proceedings / ed. Marian Bubak, Jacek Mościński. - Kraków : Academic Computer Centre CYFRONET-KRAKÓW, [1997]
s. 195-201 : abstr.
RZP
ORG
RMP
210/227
B[arbara] Stopa, L[eszek] Konieczny, B[arbara] Piekarska, I[rena] Roterman, J[anina] Rybarska, M[arek] Skowronek.
Effect of self association of bis-ANS and bis-azo dyes on protein binding.
Biochimie
1997 : Vol. 79, nr 1, s. 23-26.
AZ
AIF
IF: 1.441
211/227
Leszek Konieczny, Barbara Piekarska, Janina Rybarska, Marek Skowronek, Barbara Stopa, Barbara Tabor, Wojciech Dąbroś, Roman Pawlicki, Irena Roterman.
The use of Congo Red as a lyotropic liquid crystal to carry stains in a model immunotargeting system - microscopic studies.
Folia Histochemica et Cytobiologica
1997 : Vol. 35, nr 4, s. 203-210, il., bibliogr. 21 poz., abstr.
AP
ORG
212/227
B[arbara] Piekarska, M. Skowronek, J[anina] Rybarska, B[arbara] Stopa, I[rena] Roterman, L[eszek] Konieczny.
Congo red-stabilized intermediates in the λ light chain transition from native to molten state.
Biochimie
1996 : Vol. 78, s.183-189, il., bibliogr. 37 poz., sum.
AZ
ORG
AIF
IF: 2.160
213/227
Leszek Konieczny, Barbara Piekarska, Irena Roterman, Janina Rybarska, Marek Skowronek, Barbara Stopa.
Perspektywy wykorzystania supramolekularnych struktur ciekłokrystalicznych do stabilizacji funkcyjnej konformacji białek.
(Perspectives in using liquid crystals to stabilize functional conformation of proteins.)
Wiadomości Chemiczne
1996 : T. 50, nr 1-2, s. 29-42, il., bibliogr. 51 poz., abstr.
5 Sympozjum Polskiego Towarzystwa Chemicznego pt. Konformacja peptydów i struktura białek, Karpacz 29.04.-02.05. 1995.
RZP
POG
214/227
I[rena] Roterman, L[eszek] Konieczny.
Geometrical analysis of structural changes in immunoglobulin domains' transition from native to molten state.
Computers & Chemistry
1995 : Vol. 19, nr 3, s. 247-252, il., bibliogr.
p-ISSN: 0097-8485

AZ
ORG
AIF
IF: 1.147
215/227
J[anina] Rybarska, L[eszek] Konieczny, B[arbara] Piekarska, B[arbara] Stopa, I[rena] Roterman.
The detection of specific acute phase serum protein complexes and immune complexes by Congo Red binding.
Journal of Physiology and Pharmacology
1995 : Vol. 46, nr 2, s. 221-231, il., bibliogr. 20 poz.
AP
ORG
216/227
L[eszek] Konieczny, B[arbara] Piekarska, J[anina] Rybarska, B[arbara] Stopa, B[ogusława] Krzykwa, J[an ] Noworolski, R[oman] Pawlicki, I[rena] Roterman.
Bis azo dye liquid crystalline micelles as possible drug carriers in immunotargeting technique.
Journal of Physiology and Pharmacology
1994 : Vol. 45, nr 3, s. 441-454, il., bibliogr. 22 poz.
AP
ORG
217/227
Irena Roterman, Leszek Konieczny, Barbara Stopa, Janina Rybarska, Barbara Piekarska.
Heat-induced structural changes in the Fab fragment of IgG recognized by molecular dynamics simulation - implications for signal transduction in antibodies.
Folia Biologica (Kraków)
1994 : Vol. 42, nr 3-4, s. 115-128, il., bibliogr.
AP
ORG
IF: 0.125
218/227
B[arbara] Piekarska, I[rena] Roterman, J[anina] Rybarska, L[eszek] Konieczny, J[olanta] Kaszuba.
The melting of native domain structure in effector activation of IgG studied by using Congo Red as a specific probe.
Journal of Physiology and Pharmacology
1994 : Vol. 45, nr 1, s. 147-162, il., bibliogr. 27 poz.
AP
ORG
219/227
I[rena] Roterman, K.T. No, B[arbara] Piekarska, J[olanta] Kaszuba, R[oman] Pawlicki, J[anina] Rybarska, L[eszek] Konieczny.
Bis azo dyes - studies on the mechanism of complex formation with IgG modulated by heating or antigen binding.
Journal of Physiology and Pharmacology
1993 : Vol. 44, nr 3, s. 213-232, il., bibliogr. 21 poz.
AP
ORG
220/227
J[olanta] Kaszuba, L[eszek] Konieczny, B[arbara] Piekarska, I[rena] Roterman, J[anina] Rybarska.
Bis-azo dyes interference with effector activation of antibodies.
Journal of Physiology and Pharmacology
1993 : Vol. 44, nr 3, s. 233-242, il., bibliogr. 14 poz.
AP
ORG
221/227
J[olanta] Kaszuba, J[anina] Rybarska, L[eszek] Konieczny, B[arbara] Piekarska.
The activity of antibodies to bind antygen and initiate komplement cascade in presence of azo dyes.
Applied Biology Communications
1991 : Vol. 1, s. 225-228.
AZ
ORG
APZ
222/227
Janina Rybarska, Leszek Konieczny, Irena Roterman, Barbara Piekarska.
The effect of azo dyes on the formation of immune complexes.
Archivum Immunologiae et Therapiae Experimentalis
1991 : Vol. 39, nr 3, s. 317-327, il., bibliogr. 15 poz.
AP
ORG
223/227
J[anina] Rybarska, L[eszek] Konieczny, K[rystyna] Bobrzecka, P[iotr] Laidler.
The hemolytic activity of (Fab-Fc) recombinant immunoglobulins with specificity for the sheep red blood cells.
Immunol. Lett.
1982 : Vol. 4, nr 5, s. 279-284
p-ISSN: 0165-2478

AZ
ORG
AIF
IF: 1.229
DOI:
224/227
L[eszek] Konieczny, K[rystyna] Bobrzecka, P[iotr] Laidler, J[anina] Rybarska.
The combination of IgM subunits and proteolytic IgG fragment by controlled formation of interchain disulphides.
Haematologia (Bp., 1967)
1981 : Vol. 14, nr 1, s. 95-99
p-ISSN: 0017-6559

AZ
POG
APZ
225/227
K[rystyna] Bobrzecka, L[eszek] Konieczny, P[iotr] Laidler, J[anina] Rybarska.
The method of controlled rearrangement of protein disulphides and its use for synthesis of chimeric immunoglobulin G.
Immunol. Lett.
1980 : Vol. 2, nr 3, s. 151-155
p-ISSN: 0165-2478

AZ
ORG
AIF
IF: 0.351
DOI:
226/227
J[ulian] Blicharski, K[rystyna] Bobrzecka, L[eszek] Konieczny, P[iotr] Laidler, J[anina] Rybarska, M[aria] Ważewska-Czyżewska.
Zastosowanie elektrochromatograficznego rozdziału białek surowicy krwi w diagnostyce szpiczaków plazmocytowych i makroglobulinemii IGM.
(The use of electrochromatographic separation of serum proteins in the diagnosis of myeloma and macroglobulinaemia IGM.)
Przegląd Lekarski
1980 : T. 37, nr 3, s. 345-349
p-ISSN: 0033-2240

AP
ORG
227/227
P[iotr] Laidler, L[eszek] Konieczny, K[rystyna] Bobrzecka.
The controlled disulphide crosslinking of difeerent proteins as a method for synthesis of combined protein antigens and copolymers of other design.
Mol. Immunol.
1979 : Vol. 16, nr 2, s. 141-144
Formerly Immunochemistry (do 1978)
p-ISSN: 0161-5890

AZ
ORG
AIF
IF: 1.738
  Wyświetl ponownie stosując format:
Wyświetl/ukryj etykiety | Wyświetlenie wyników w wersji do druku | Pobranie pliku do edytora | Nowe wyszukiwanie | Biblioteka Medyczna UJ